《玛丽和马克思》是一部根据真实故事改编的黏土动画电影，是澳大利亚出品的第二部以定格的方法拍摄成的动画，第一部是《9.99美元》。该影片是一部讲述笔友之间20多年友情的动画作品，同时这也是导演亚当·艾略特的半自传式的影片。
整部动画片是由大约132480张独立的画面制作而成，剧组一共用了6台佳能数码相机拍摄这些静止的画面。影片中的所有文字——那些出现在街角商店橱窗里的文字、招牌上的文字、包装上的文字、啤酒瓶上的文字、玛丽和马克思之间的书信上的文字——统统是亚当·艾略特亲自书写。
影片的开头向我们介绍了主人公玛丽是家在澳大利亚墨尔本的一个8岁的小女孩，她妈妈是个酒鬼，爸爸沉迷于鸟儿标本。小玛丽总是因为额头的胎记而被同龄人嘲笑，她很孤独，没有人愿意和她做朋友，除了邻居雷恩，一个因为在战争中失去双腿而退役，并因此患上陌生环境恐怖症的可怜的老头，玛丽每周帮他取下门口邮箱中的邮件。某一天凭着电话黄页上的一个地址，心血来潮给美国纽约的陌生人马克思写信，从此两个孤独的灵魂开始了一段延续18年的笔友关系，在一封封天真而怪诞的信中，流淌的是对温情、交流、理解的渴望。
马克思是一个肥胖古怪的阿斯伯格综合征患者。阿斯伯格综合征有某些特征类似孤独症，如人际交往障碍，刻板、重复的兴趣和行为方式，与孤独症不同的是，AS者并无明显的语言和认知能力损害，智力正常，甚至有少数AS者具有某些方面的超常禀赋。
片中，马克思在精神病救助中心诊断出患了AS后，长达八个月住院治疗而未给玛丽回信，他在出院后的回信中写道：“我把这种病的特征说给你听吧。第一，我发现世界混乱而令人困惑，因为我的思维严谨而又讲究逻辑。第二，我很难理解别人脸上的表情。我年轻的时候，做了一个本本，上面有好多表情和它们的意义，一有疑惑我就向那个本本寻找答案，可我还是不能和某些人沟通。艾薇的面部表情尤其难理解，因为她的眉毛是假的，脸上还有皱纹。第三，我字写得不好，敏感，笨拙……还会非常焦虑。第四，我喜欢玩魔方，艾薇说这是好事。最后第五点，我表达情感有问题。"
马克思跟玛丽一样，没有朋友，除了邻居艾薇，一个盲人老太太，在偌大的纽约城中，机械的生活，直到玛丽的来信打破了他平静普通的生活。
马克思在给玛丽的信中写道：“有件事我倒是想改变。我希望我能在适当的时候哭出来。我挤呀挤呀……但什么都没有。切洋葱时才哭，但这不算。”这是他唯一想改变的一件事。
当玛丽寄来的装满自己眼泪的瓶子到达马克思手中时，他在心中真正认可了这个朋友。他用滴管将眼泪点在自己的脸上，感受着正常人的情感，可能对他来说，这一刻他才是真正活着。
他们之间的友情故事常常让人动容。玛丽告诉马克思自己爱吃巧克力，这让她感到愉快，但是因为额头上的黄色胎记，常常遭到同学伯尼的嘲笑，这给她的生活带来了极大困扰。马克思想出了一个办法：“告诉伯尼，你的胎记是巧克力变的，也就是说，当你进天堂后，你将会掌管所有的巧克力。”之后玛丽将马克思的话转告给伯尼，她将掌管所有的巧克力，而他一块都吃不到，伯尼再也不敢欺负她了。
玛丽将胎记和巧克力联系起来，胎记不再是被人取笑的把柄，而是引以为傲的资本。从此，她可以正视他人对自己的评价，克服了自卑心理，变成一个独立自主、勇于追求自己爱情和事业的女性。
玛丽的研究围绕着阿斯伯格综合征进行，希望自己的研究能够帮助到马克思，但是当她告诉他自己出版了一部围绕他的经历的书籍并大火时，却激怒了他。打字机键盘上的“M”，是导演在影片中设立巧妙的一把“钥匙”。二人的姓氏首字成为了一个纽带，马克思一度无法原谅玛丽，亲手把它掐断，然后寄给了玛丽。
善良的玛丽心中太过于依靠马克思，没有了这把钥匙，生活就失去了光彩，甚至于丈夫也离他而去。影片在两人突然断交时，出现了一个转折点，揭示出每个人心中的依恋和脆弱，马克思和玛丽如此，观众也一样。
玛丽一度酗酒，甚至绝望想要自杀，但在最后一刻被克服自己出门的雷恩的敲门声救下，他带来了马克思寄来的包裹。“亲爱的玛丽，请接受我搜集的全部Noblet，作为我原谅你的信号……我原谅你是因为你不是完人，我也不是，人无完人。即便是那些在我门外乱扔杂物的人。当我年轻的时候，我想变成任何一个人，除了我自己。伯纳德医生说，如果我在一个孤岛上，那么我就要适应一个人生活，只有我和椰子。他说我必须要接受我自己，包括我的缺点。我们无法选择我们的缺点，它们也是我们的一部分，我们必须适应它们。然而，我们能选择我们的朋友。我很高兴选择了你。
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