【时间】 2023年9月19~29日
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【1】Multi-omics analysis of mucosal and systemic immunity to SARS-CoV-2 after birth：分析新生儿与母亲的血液和鼻样本中的粘膜和系统免疫，表明新生儿早期SARS-CoV-2感染后具有强大而持久的免疫力。
婴儿对感染的免疫动力学尚不明确。为了深入了解婴幼儿对新型冠状病毒（SARS-CoV-2）的严重急性呼吸综合征免疫情况，科研人员采用多组学方法对婴幼儿进行了纵向分析，包括分析感染前、感染期和感染后的Omicron和非Omicron变异体的血液样本和每周鼻拭子样本。感染刺激了强大的抗体滴度，与成人不同的是，这些抗体在300天内没有显示出衰减的迹象。婴幼儿产生了强大的黏膜免疫应答，其特征为炎症性细胞因子、干扰素（IFN）α以及辅助T细胞（Th17）和中性粒细胞标志物（白细胞介素[IL]-17、IL-8和CXCL1）。血液中的免疫应答表现为先天免疫细胞上活化标志物的上调，没有炎症性细胞因子，但出现多种趋化因子和IFNα。后者与病毒载量以及单细胞多组学测定的髓系细胞中干扰素刺激基因的表达相关。总体而言，这些数据提供了婴儿在生命的最初几周和几个月对感染的免疫情况的一个快照。
据推测，一个人在成长发育过程中可塑性是逐渐减弱的。小孩子由于知识储备和生活经验不足，所以对于外界环境的适应能力比成年人差，但是在基因表达调控方面比成年人应该强。
【2】An AsCas12f-based compact genome-editing tool derived by deep mutational scanning and structural analysis：基于深度突变扫描和结构分析，生成微型AsCas12f变体，可提高其活性，使用全一AAV载体在小鼠中实现了高效的插入/敲除活性和转录激活。
【3】Synthetic Par polarity induces cytoskeleton asymmetry in unpolarized mammalian cells：使用设计的蛋白合成人工细胞极性，揭示重建Par复合物极性足以驱动非极性哺乳动物细胞的不对称细胞分裂等关键过程。
【4】The local microenvironment drives activation of neutrophils in human brain tumors：鉴定脑肿瘤相关中性粒细胞的发病机制，并通过人和小鼠中的细胞、分子和图像数据集确定其多方面的促肿瘤表型。
【5】Systemic immune profiling of Omicron-infected subjects inoculated with different doses of inactivated virus vaccine：分析接种灭活病毒疫苗对SARS-CoV-2感染的免疫反应，为已接种此类COVID-19疫苗人群的单个和双次增强剂量相对效果提供了见解。
SARS-CoV-2主要株疫苗接种可依赖于增强剂对Omicron变异体引起的感染、症状发生和疾病严重程度发挥保护作用。然而，其基础机制尚不清楚。在2022年上海Omicron爆发期间，科研人员招募了122名感染成年人和50名未感染的对照组，其中包括未接种或接种了两或三剂COVID-19灭活疫苗，并在他们的外周血样本上进行了41-plex CyTOF、RNA-seq和Olink的综合分析。增强疫苗倾向于提高HLA-DRhi经典单核细胞、非经典单核细胞和类Th1记忆T细胞的频率，而Treg的频率则会因疫苗接种剂量而减少，并以疫苗剂量依赖的方式影响症状发生。相关性分析和机制分析表明，增强疫苗接种诱导了单核训练，这将在Omicron感染时引发单核活化和成熟，而不是分化为髓系来源的抑制性细胞。总的来说，科研人员的研究提供了关于增强疫苗如何跨越SARS-CoV-2变异体产生保护性免疫的见解。
【6】Influence of autozygosity on common disease risk across the phenotypic spectrum：揭示源于近亲婚姻的同源性与包括2型糖尿病在内的几种复杂疾病的发生有因果关系。
【7】Amyloplast sedimentation repolarizes LAZYs to achieve gravity sensing in plants：探究植物利用淀粉粒沉淀来完成重力感知和响应的分子机制。
【8】SARS-CoV-2 variants evolve convergent strategies to remodel the host response：研究SARS-CoV-2的变异体如何调节病毒蛋白质表达、磷酸化和病毒宿主蛋白质相互作用，进而影响宿主免疫反应；提示预测病毒传播和应对未来病毒大流行的重要意义。
在COVID-19大流行期间，出现了多种引起关注的SARS-CoV-2变异株（VOCs）。科研人员采用无偏的系统方法研究了驱动VOC进化的宿主选择性力量。科研人员发现VOCs演化出了一致的策略，通过调节病毒RNA和蛋白水平、改变病毒和宿主蛋白的磷酸化以及重塑病毒-宿主蛋白相互作用来改变宿主。综合计算分析显示，尽管Alpha、Beta、Gamma和Delta最终都收敛于抑制干扰素刺激基因（ISGs），但Omicron BA.1没有这样做。ISG的抑制与病毒天然免疫拮抗蛋白的表达相关，包括Orf6、N和Orf9b，科研人员对其进行了具体突变的映射。后来的Omicron亚变种BA.4和BA.5比早期亚变种BA.1更有效地抑制先天免疫，这与Orf6的水平相关，尽管在BA.4中由于一个破坏了Orf6与核孔相互作用的突变而减弱。科研人员的发现表明，SARS-CoV-2的收敛进化克服了人类适应性和先天免疫屏障，为应对未来的大流行奠定了基础。
【9】Mpox infection protects against re-challenge in rhesus macaques：通过模拟Mpox感染以研究天然免疫力对再次感染的保护效果。
【10】Host traits shape virome composition and virus transmission in wild small mammals：大规模调查哺乳动物virome发现不同的啮齿动物、蝙蝠和鼩鼱之间存在差异，揭示了宿主范围、传播和潜在病原体跨物种传播的信息。
"Virome"可以翻译为"病毒组"。它指的是在某个生物体内寄生的全部病毒群体，包括感染病毒、潜伏病毒和病毒颗粒。Virome研究是关于病毒在宿主生物体内的多样性、数量、相互作用以及对宿主健康的影响的研究。
蝙蝠、啮齿动物和小鼠是人类传染性疾病最主要的动物来源，但它们之间的病毒进化和传播仍大部分未被探索。通过对来自中国四个栖息地的2443只野生蝙蝠、啮齿动物和小鼠的内脏器官和粪便样品进行元转录组测序，科研人员鉴定了669种病毒，其中包括534种新病毒，从而大大扩展了哺乳动物宿主病毒组成。科研人员的分析揭示了高水平的系统发育多样性，识别出了跨物种的病毒传播事件，阐明了病毒起源，并确定了无脊椎动物病毒在哺乳动物宿主中的情况。宿主目和样本大小是影响病毒组成和溢出模式的最重要因素。小鼠携带具有更强的宿主跳跃能力的病毒，而鼩鼱则寄生着大量病毒，包括许多与无脊椎动物相关的病毒，具有多器官分布。这些数据凸显了当地栖息地哺乳动物病毒多样性和它们在新宿主中出现的能力。
该研究揭示了野生小型哺乳动物的病毒组成和传播方式，揭示了宿主特征对病毒传播的影响。这些研究为我们深入了解新冠病毒以及野生动物与病毒之间的关系提供了重要的信息。
【11】Stepwise emergence of the neuronal gene expression program in early animal evolution：早期动物进化中神经元基因表达程序是逐步出现的。
本文研究了早期动物进化中神经基因表达程序的逐步出现。研究人员通过对不同种类的海绵、水螅和虫等富含原始神经系统的生物进行转录组分析，并发现神经相关基因在这些动物中呈现出逐渐增加的趋势。同时，该研究还揭示了一些与神经发育相关的基因家族的起源和演化过程，并证明了在早期动物进化中，神经系统的形成与逐渐复杂化是一个逐步出现的过程。这项研究为我们更好地理解神经系统的起源和进化提供了新的视角和证据。
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