GEO数据库

生信挖掘的常用数据库GEO使用教程：

1、用必应搜索GEO（不要用百度搜，会出现一堆不相关的结果）：

2、进入官网后，选择series或datasets，两种方法找到的结果不一样，比如说你搜MSI，会出现不同的数据集结果，可以都试一下以便查找自己想要的数据集：

3、找到自己刚兴趣的数据集后，我们来了解一下详情页都有哪些东西需要注意，以芯片数据为例：

Series Matrix File是表达量数据矩阵，GSE4045_RAW.tar是原始数据集。一般来说下载Series Matrix File是最方便的，但是下载完之后会有许多问题，比如说表达量来源（MAS5 ，RMA ，RPKM，FPKM，TPM还是原始的counts）？芯片对应的基因怎么置换？请听下回分解！