为什么做肾穿刺活检?因为许多临床分型方法不能明确诊断，在判断预后等方面存在很多不足、而采用肾活检有利于明确诊断、指导治疗、判断预后、探讨临床分型与病理分型的关系，也是提高肾脏病临床与科研水平的重要手段之一，具体而言。
首先应用肾穿刺活检可以明确诊断，肾活检与尸检的诊断符合率高达84%。特别是由于近年来电镜与免疫病理学的飞速发展，大大促进了肾脏病的诊断水平。目前肾脏病的诊断方法基本上有3种，一是临床诊断，二是病理诊断，三是免疫病理诊断，后两种诊断常结合应用，必须依靠肾穿刺活检，而诊断最有意义。
例如，临床上表现为原发性Ⅱ型肾病综合征，病理上却可见于多种病变类型，如中至重度系膜增殖性肾炎、IgA肾病、膜增殖性肾炎、局灶节段肾小球硬化等，而最后确诊应依靠病理与免疫病理诊断。再如，临床上诊断为慢性肾小球肾炎，其病理表现更是多样化。而且许多易于漏诊的病变，只有依靠肾活体组织检查才能确诊，如间质性肾炎、IgA肾病、IgM肾病等。
其次，通过肾穿刺活检明确诊断后，可为临床制定治疗方案、修正治疗方案，提供重要的依据。再以原发性肾病综合征为例，若肾穿刺活检诊断为微小病变型，则应用激素治疗效果良好，Ⅱ型肾病综合征根据病理类型不同，对激素治疗的反应性也不同，某些病理类型加用细胞毒性药物后，反而取得了良好的效果。在急性肾脏病，尤其急进性肾炎，肾穿刺活检是确诊的指标。当肾穿刺活检明确诊断后，就可以采用大剂量激素冲击疗法，对抢救急危重症，具有重要意义。在判断预后方面，肾穿刺活检明确诊断后，基本上可以估计病变的预后，临床上诊断为同一类型的肾炎，病理上则有不同的表现，其预后也不尽相同。
此外，由于肾穿刺活体组织检查法的开展，也为我们探讨肾脏病临床与病理的关系提供了方便，尽管目前尚无可靠的结论，但对于该领域的深化研究以及探讨肾脏病发病机理，推动肾脏病临床和科研的深入开展。肾脏病学的发展，具有重要的作用。
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