鱼类烂鳃中的
慢性烂鳃与急性烂鳃
柱状黄杆菌引起的烂鳃往往是慢性烂鳃，发病慢，持续时间长，治疗较难，鳃组织首先呈现炎性水肿，然后才是增生和坏死。发病初期，鳃小片上的毛细血管轻度充血，鳃丝末端肿大积水，随着病情加重，呼吸上皮细胞开始肿大，当上皮细胞过度增生，形成上皮细胞板时，细胞会产生坏死变性。到后期开始引发烂鳃，毛细血管与呼吸上皮细胞完全分离，鳃丝末端一部分积液开始渗出，一部分鳃丝出现出血。
在上皮细胞肿胀的过程中，鳃丝开始棍棒化，上皮细胞增生导致鳃小片相相互融合，阻碍鱼体内二氧化碳与废物与水体中氧气的交换，造成溶氧胁迫，加重鱼体发病。为了保持血液中的溶氧充足，鱼的呼吸加速，刺激粘液细胞亢进，增生并分泌大量粘液。
当炎性水肿达到一种程度，最终导至肿胀至棍棒化的鳃丝出现破裂，鳃丝内积液流出，毛细血管开始裸露，上皮细胞开始坏死脱落，并造到细菌和真菌感染，开始附着淤泥与原生动物，毛细血管开始萎缩并最终消失，鳃丝软骨外露。
急性型的病理变化是鳃组织一般只有不严重增生的炎性水肿和坏死；相比慢性型的坏死的面积和程度大而严重，鳃小片坏死解体，只留下毛细血管痕迹，甚至鳃丝软骨也烂去一段。
对于慢性烂鳃通过外用消毒剂，如复合碘一瓶用到2-3亩水体，或是聚维铜碘用到1.5至2亩水体、滨阳高碘用到4-5亩水体，还有混养混血烂鳃停用2.5至3亩水体，这些都可以用到外用水体消毒上，特别发现有上层鱼，如花白鲢、野杂鱼等出现死亡时，说明水体中的病源菌浓度太高，最好是用两次外用消毒剂，当遇到水体中有机质过多时，也务必按最大剂量使用用，以保证疗效。
许多时候，出现烂鳃，病源菌就已经深入鱼的机体内部，往往可以从鱼的肝肾分离到细菌，所以这人时候，除了对水体消毒外，内服是很有必要的，可选用对病源菌敏感的抗生素加以内服，而且还要注意内服的时间天数和内服的药物剂量。
通常可以选用狄诺康加上新安康加鱼康肠，还有维生素CE，在添加粘合剂的基础上，按每天投喂一次内服药，连续内服5-7天，有时遇到个别养殖户觉得成本太高，我们也是坚持认为，至少要内服四到五，如果内服时间太短，是很难达到内服效果的。对于急性烂鳃，则重点是外用药，如五黄精华素加上碘大剂量的外泼，严重的时候还可以把鱼康免疫多糖加上外泼。
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