我国生产菌糠总量约900万吨，其主要基质是锯木屑、稻草、玉米芯、甘蔗渣、棉籽壳等多种农业秸秆及酒糟、醋糟等。据大连全禾菌业有限公司、辽宁省朝阳市食用菌研究所测定，这些基质经过多种微生物的发酵作用，纤维素、半纤维素和木质等均已被不同程度的降解，粗蛋白、粗脂肪均比不经过发酵前显著提高，粗纤维素明显降低，并且含有较丰富氨基酸、菌类多糖及Fe、Ca 、Zn、Mg等微量元素。利用食用菌菌糠开发农作物附产物作动物饲料、有机肥料，无凝是发展循环经济的一条好途径。随着菌种的筛选培育、处理工艺的日臻完善，利用农作物秸秆和工业废液发展“食用菌——养殖业——种植”综合开发模式，有着广阔前景。但今后应重点开展下列两方面的工作，以提高菌糠的使用价值：一是采用基因工程和细胞融合等技术筛选培育产菌能力强、菌丝体生长又茂盛的菌种应用，以进一步提高菌糠的营养价值。二是结合氨化、微贮、膨化或热喷处理技术，寻求尽可能地提高菌糠饲用价值，增加其使用比例的途径。菌糠（培养基）可利用再生产食用菌，出完菇后菌糠喂猪，猪粪进入沼气池产生沼气为农户提供燃料，沼气渣再施入大田成为肥料，这样形成一个循环链。
食用菌能在富含纤维素的物质上生长繁殖，是因为食用菌在生长过程中，能产生大量分解纤维素、半纤维素的复合酶，降解木质素的过氧化酶和漆酶，把农作物秸秆等附产物中的纤维素、半纤维素和木质素分解成葡萄糖、醌类化合物等成份供给食用菌和菌丝体生长繁殖，它的营养价值得到显著改善。
用稻草、麦秸、干牛粪以3：2：5的比例组成的培养基，采蘑菇5批后晒干粉碎的菌糠，粗蛋白为10.2%、粗纤维9.32%、粗脂肪0.12%、无氮浸出物48%、钙3.24%、磷2.1%、赖氨酸1.2%、色氨酸0.8%、蛋氨酸十胱氨酸1.2%。
以木屑或砻糠为主要原料栽培香菇的菌糠，它们的粗蛋白、粗脂肪、粗纤维、矿物质和无氮浸出物分别为8.67%、6.2%、30.58%、7.93%、42%和7.82%、8.9%、25.63%、2.79%、33.3%；
以玉米芯为原料栽培香菇的菌糠的营养含量粗纤维从36.1%下降到24.4%，木质素从13.2%下降到9.5%，粗蛋白从2%上升到9.5%。
棉籽壳菌糠中含粗蛋白质13.06%、粗纤维31.56%、粗脂肪4.20%、粗灰分10.89%、无氮浸出物33.01%、钙0.21%、磷0.07%。
可见，食用菌培养基通过食用菌菌体的生物固氮作用、酶解作用等一系列生物转化过程，粗蛋白质、粗脂肪含量均比不经过食用菌发酵前明显提高，纤维素、半纤维素、木质素和抗营养因子均已被不同程度的降解，同时还产生了多种糖类、有机酸类和生物活性物质。
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