费用的概念：
费用是指报告期内导致政府会计主体净资产减少的、含有服务潜力或者经济利益的经济资源的流出。
费用的确认计量：
预算支出的概念：
是指政府会计主体在预算年度内依法取得并纳入预算管理的现金流出。
确认计量：
收付实现制的计量方式，在实际支付时确认，以实际支付的金额计量
会计要素不同
《政府会计制度》中的费用是财务会计中的会计要素，而预算支出是预算会计中的会计要素
核算原则不同
它们的核算原则各不相同。费用的核算是依据权责发生制的原则，而预算支出的核算是依据收付实现制的原则。
权责发生制：是指以取得收取款项的权利或支付款项的义务为标志来确定本期收入和废机油的会计核算基础
就是说：不论是否支付，凡是当期已经已经发生的或应当负担的费用，都应算做当前费用
收付实现制：是指以现金的实际收付为标志来确定本期收入和支出的会计核算基础。
就是说：只要是当前实际支付的，都当做当前的支出
核算口径不同
因为核算原则不同，因此费用和预算支出的核算口径会有所差异。
比如：购入货物或接受劳务的应交增值税，财务会计下计入费用的是不带增值税的金额，增值税计入“应交增值税”可抵扣。而预算支出的事业支出记录的金额是包含应交增值税的，它以实际交付的金额为准，这样产生的差异是永久性的。
会计科目的明细核算要求不同
预算会计中的预算支出科目明细核算侧重于资金来源类的归类核算，而财务会计中的费用类科目可以根据实际需要自行制定资金来源和功能分类的明细核算结构。
费用和预算支出科目的对应关系
财务会计科目下“业务活动费用”“单位管理费用”对应预算会计下的“事业支出”，“经营费用”对应“经营支出”，“上缴上级费用”对应“上缴上级支出”，“对附属单位补助费用”对应“对附属单位补助支出”，“其他费用”和“资产处置费用”对应“其他支出”，
费用和支出类对应有一些特别的地方：
财务会计下有在“所得税费用”，在预算会计下是没有相应的支出对应，它是和结余类科目“非财政拨款结余”科目对应，
预算会计下“投资支出”对应资产类科目“短期投资”、“长期股权投资”“长期债权投资”，“债务还本支出”对应“短期借款”和 “长期借款”
从同级财政获得的资金收入在实际收到的时候都会确认为“财政拨款预算收入”和“财政拨款收入”，财政和预算核算的内容和范围相同。
基于对应关系和处理基础的不同，在预算会计和财务会计下会产生收入和预算收入、费用和预算支出会形成相应的差异事项，我们借鉴企业会计的原理，归纳为永久性差异和时间性差异。由于核算基础的不同，就会带来这两类的差异。
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