小说追溯到明朝嘉靖三十四年四月，倭寇入侵嘉定，企图占领嘉定。一天午夜过后，倭寇偷袭，虽传来阵阵狗叫声，但并未引起守城官兵的警觉。住在西门城墙旁的13岁男孩起床撒尿，听到一阵紧一阵的狗叫声，急忙赶至西门城下，发现倭寇爬云梯袭城。小男孩速速攀上城墙，发现倭寇成群结队在爬云梯。机警的小男孩不顾自己的安危，便大声呼叫“贼兵来了”，稚嫩的童声划破夜空。他还不断地敲锣，一路呼叫，唤醒了全城的百姓。大家奋起登城抵抗，击退了倭寇。突然，一支冷箭射来，小男孩应声倒地而死。小男孩以他的生命保住了嘉定城，从此，大家亲切而沉痛地叫他“石童子”。
黄华旗花了一年多的时间，循历史、查资料、访民间，追寻石童子。在收集、积累、梳理的基础上，他以儿童小说的文笔，塑造了一个聪明、机智、勇敢而又不乏调皮、淘气性格的少年石童子。
小说不仅还原了历史的童真、童趣，为孩子们寻找有根的文学找到依据，而且还彰显了国人血脉中的民族精神。
