肝癌的治疗过去主要以切除为主，但晚期肝癌失去了手术治疗的机会。
现在，很多新的手段可以用于肝癌的治疗，比如肝移植、肝动脉介入栓塞、射频消融及分子靶向药物治疗等。
目前临床上常用的治疗手段各有优缺点，也分别有各自的适应证，在选择治疗方案时，应当充分考虑肿瘤的部位、范围、生长速度、肝功能状况、年龄以及经济承受能力等因素，制定疗效最佳、副作用最少且适合患者经济状况的综合治疗方案，发挥所有治疗手段的综合优势。
肝癌的治疗可采取手术切除和多学科的综合治疗模式。
手术治疗
早期肝癌的治疗仍以手术切除为首选，是提高生存率的关键，肿瘤越小五年生存率越高。由于根治切除仍有相当高的复发率，故术后宜定期复查AFP及超声显象以免复发。
肝移植术虽不失为治疗肝癌的一种方法，国外报道较多，但在治疗肝癌中的地位长期未得到证实。肝移植术后需要长期免疫抑制剂的应用， 病人常死于复发，由于供体来源及费用问题仍难以推广。
姑息性外科治疗，适用于较大肿瘤或散在分布或靠近大血管区或合并肝硬化限制而无法切除者，方法有肝动脉结扎和(或)肝动脉插管化疗冷冻激光治疗、微波治疗术、肝动脉栓塞治疗或无水酒精瘤内注射等，有时可使肿瘤缩小、血清AFP下降，为手术切除提供机会。
肝动脉栓塞化疗（TACE）
这是80年代发展的一种非手术的肿瘤治疗方法，对肝癌有很好疗效甚至被推荐为非手术疗法中的首选方案。
化疗药常用CDDP、5-Fu、丝裂霉素等，化疗应反复多次治疗效果较好，对肝功能严重失代偿者、门脉主干癌栓阻塞者为禁忌。
无水酒精瘤内注射
超声引导下经皮肝穿于肿瘤内注入无水酒精治疗肝癌，以肿瘤直径≤3cm、结节数在3个以内者、伴有肝硬化而不能手术的肝癌为首选，对小肝癌有可能治愈，对≥5cm的肿瘤效果差。
放射注射
由于放射源放射设备和技术的进步，各种影像学检查的准确定位使放射治疗在肝癌治疗中地位有所提高，疗效亦有所改善。
放射治疗适于肿瘤仍局限的不能切除肝癌，通常如能耐受较大剂量，疗效较好。
化疗
对肝癌较为有效的药物有CDDP、5-Fu、阿霉素(ADM)及其衍生物、丝裂霉素VP16、吉西他滨、紫杉醇类等。
一般认为，单个药物静脉给药疗效较差，采用肝动脉给药和(或)栓塞以及配合内外放射治疗应用较多，效果较明显。
对某些中晚期肝癌，无手术指征且门静脉主干有癌栓阻塞，不宜肝动脉介入治疗者和某些姑息性手术后患者，可采用联合或序贯化疗常用联合方案有一定效果。
靶向药物治疗
多吉美（索拉非尼）为第一个批准用于肝癌治疗的靶向药物，由德国拜耳制药公司研制，可同时作用于肿瘤细胞和肿瘤血管。
它既可通过阻断由RAF/MEK/ERK介导的细胞信号传导通路而直接抑制肿瘤细胞的增殖，还可通过抑制血管内皮生长因子受体(VEGFR)和血小板衍生生长因子受体(PDGFR)而阻断肿瘤新生血管的形成，间接地抑制肿瘤细胞的生长。
肝癌是一种伴有VEGF高表达的血管肿瘤，因此索拉非尼也在抑制血管生成方面作用明显，对肝癌的治疗效果显著。 亚太地区进行的索拉非尼治疗晚期肝癌的临床研究均显示出索拉非尼的生存获益。
瑞格非尼作为一种新型小分子多激酶抑制剂,可用于治疗胃肠道间质瘤，瑞格非尼可广泛抑制与血管生成和肿瘤发生相关的激酶，如血管内皮生长因子受体VEGFR1-3、酪氨酸蛋白激酶受体TIE和Ret、血小板衍生生长因子受体PDGFR-β、碱性成纤维母细胞生长因子受体FGFR-1、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶Raf以及有丝分裂原活化蛋白激酶p38等，从而发挥抗肿瘤作用。
目前瑞格非尼已经被FDA批准用于结直肠癌和胃肠间质瘤以及肝癌的治疗，最新的结果显示瑞格非尼用于经多吉美治疗后耐药（失败）的晚期肝癌患者有显著的疗效！
一项国际3期临床试验发现瑞格菲尼可以提高晚期肝细胞性肝癌（HCC）病人的总生存期，这使肝癌病人多了一个选择。
瑞格非尼已于12月12日被中国食品药品监督局正式批准，适用于既往接受过索拉非尼治疗的肝细胞癌（HCC）患者。这是继索拉非尼上市10 以来， CFDA 首个批准治疗肝癌的新药。
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