常用生物数据分析软件有以下几种：
 
1. R语言：R是一种自由、免费的统计分析和图形学软件，非常适用于生物数据分析。R语言拥有丰富的统计方法、数据处理和可视化功能，而且有很多生物数据分析的包，如Bioconductor。
 
2. Python：Python是一种通用的编程语言，也非常适用于生物数据分析。Python有很多强大的科学计算库，如NumPy、SciPy和Pandas，还有专门用于生物信息学分析的包，如Biopython。
 
3. MATLAB：MATLAB是一种用于科学计算和数据可视化的高级编程语言和环境。MATLAB提供了丰富的统计和机器学习工具箱，适合于生物数据分析。
 
4. SAS：SAS是一种广泛应用于统计分析和数据管理的商业软件。SAS提供了丰富的统计方法和数据处理功能，适用于生物数据分析。
 
5. SPSS：SPSS是一种常用的统计分析软件，适用于生物数据分析。SPSS提供了丰富的统计方法和数据处理功能，还具有友好的用户界面。
 
除了上述软件外，还有一些专门用于特定领域的生物数据分析软件，如：
 
- BLAST：用于核酸和蛋白质序列比对和数据库搜索。
- GeneSpring：用于基因表达数据分析和可视化。
- GSEA：用于基因集富集分析。
- Cytoscape：用于生物网络分析和可视化。
- IGV：用于基因组数据的浏览和分析。
 
这些软件都有自己的特点和适用范围，选择合适的软件取决于具体的研究目的和需求。