这两个单位都属于市直机关单位，在外人眼里都还不错，抛开工作职责、重要性不说，就发展前途来看，选择纪委的应该是主流。
第一，从提拔晋升前景看。
自然资源局是机构改革后合并的部门，在普通地级市为正处级。由于是国土、规划、海洋、林业等多个部门合并而来，机构多、人员多，短期内人心难以真正融合到位，内部各成体系比较普遍。很多地市一级的自然资源局合并后几百上千人，竞争十分激烈，想要提拔难度非常大。
市纪委监委是市委常委主管部门，在普通地级市纪委书记是副厅，副书记基本是正处。级别高，职数多，晋升的空间大。纪委机关十多个室主任都是副处，而自然资源局的中层只能是正科。
在市纪委即使不当领导，只要不犯大错，到退休前基本都能解决四调待遇。如果跟对了领导，提拔一个副处实职并不算难事，既可以在单位内部解决，比如提拔重要科室的负责人或者巡察办、纪检组领导，也可以外放县区担任常委纪委书记。但是对于自然资源局，四调是给中层正职准备的，普通的工作人员最多解决一个一级主任科员就很不错了。
第二，从业务话语权上看。
自然资源局因为掌握土地招拍挂、城市规划、矿产资源管理等权力，相对其他部门而言堪称强势部门、要害部门，本身地位不低。而且经常跟企业打交道，企业都非常尊重，接触的人对上是市级领导对下是财大气粗的老板，但同时风险也大。
纪委监委掌握监督执纪权，市级各部门都会给面子，无论在各种考核还是表彰，市纪委基本都榜上有名。
而自然资源局虽然排位在政府各线条部门的前列，但也是一个普通的职能部门，管不了其他部门，其他部门往往对它都是公事公办。
换言之，自然资源局管不到纪委，而纪委分分钟可以管自然资源局，一个是监管者，一个是被监管对象。
第三，工资待遇。
现在的机关单位工资待遇都是统一按照政策规定走，工资待遇上纪委会多一块纪检补贴，其他同职级的没有太大差别，基本上谁晋升快工资待遇就高。
总而言之，所谓机关部门好和不好，主要看仕途发展前景，其次专业特长和业务话语权，其他就不需要做什么比较了。因此，果断纪检监委。
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