1907年由美国基督教会、南北长老会、卫理公会等四个教会在原教会开办的金陵女子圣经学院校（前身南京圣道书院）基础上联合创办金陵神学院，旧址位于南京汉中路140号。
学院是为中国教会培养牧师、传道人、神学院教师和基督教研究人才。学院的办学宗旨是：培养爱国爱教、坚持自治、自养、自传（三自）方针、灵德智体群全面发展、在灵性修养和神学知识上有较高造诣、善于团结信徒、乐意服务教会和社会的教会人才。
已故中国科学院院士陈梦熊在他的口述自传：《登山涉水 图罗四渎》中说到，他的父亲陈金镛曾任金陵神学院提调（院长），也是创办人之一。实际上陈金镛是中方负责人。外方负责人是司徒雷登。1908年开始，司徒雷登在金陵神学院任教，教授希腊文达11年之久。1912年，金陵神学院并入位于大锏银巷17号的金陵女子神学院，更名为金陵女子神学院。1917年，再改名为“金陵神学院”。抗战时期，金陵神学院迁往上海和成都，战后又迁回南京。现在校址是位于南京上海路大锏银巷金陵女子神学院旧址，汉中路金陵神学院旧址已于1950年代划给南京医科大学，该校行政楼即监理会在金陵神学院内所建的百年堂。巴洛克风格的校长楼是当年金陵神学院的教学大楼。
1952年，在当时南京金陵神学院的基础上，由华东地区11所神学院及圣经学校联合而成金陵协和神学院，院长为丁光训。2009年3月金陵协和神学院搬到江宁大学城，大锏银巷旧址已变身艺术金陵文创园。
江宁区大学城樵歌路100号新建的金陵协和神学院校址
神学院占地30市亩，建筑面积达9,000平方米。
大锏银巷旧址·艺术金陵文创园
新旧建筑融合。
位于南京闹市区的大锏银巷17号金陵神学院旧址，占地30余亩，闹中取静，毗邻沈举人巷张治中公馆和慈悲社民国建筑群。院内绿地、大树茵茵，尤以3幢民国建筑最具特色：圣道大楼和两栋学生宿舍楼。这三栋建筑建于1921-1922年，由金陵大学工程院设计，陈明记营造厂承建。圣道大楼为欧洲教堂风格,立面对称，建筑平面布局呈十字形，主体2层，门厅为3层，砖木结构，建筑面积1560平方米，青砖外墙，木屋架，木楼板，窗户采用上下提拉木扇。两幢学生宿舍楼，分别建在圣道大楼的西侧和东北部，建筑造型基本相同。建筑面积1560平方米，建筑主体二层，中央三层，砖木结构，具有美式建筑特征，青砖墙面，水泥瓦屋面。主楼中央后部的小礼堂内部装饰具有较浓的宗教特征。旧址内建筑群体保护完整，周围环境优美完好。
大锏银巷校址
位于南京汉中路140号的金陵神学院旧址现在置身于南京医科大学校园内东南角。周围都是后建的楼宇。但是那巴洛克风格的建筑虽然斑驳依然让人眼前一亮！据学校宣传部的老师介绍，20世纪70年代时，原金陵神学院的老建筑尚存五幢。现在保留下来的只有两幢了，就是当年的百年堂和教学大楼（现在分别是学校行政楼和校长楼了）。
汉中路校址
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