Blast是生物信息最最经典的工具了~
之前也和大家多次分享关于NCBI或者blast的内容
NCBI的blast虽然好,可是在线版总是有各种各样的限制,真正的生物信息分析大多还是使用服务器的命令行版本使用。可是,也不是所有人都会使用服务器。
那么,除了在线版 和 Linux服务器版,是否还有第三种选择吗?
有的,现在我们也可以用自己的办公电脑Windows系统玩转Blast了呢~~
具体怎么做呢?
首先,让我们下载windows版本的blast安装包。
链接如下:
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/
链接中有非常多的压缩包,我们只需要下载红色框标注的那个~
注意!是win64.exe结尾的那个文件哦~
下载后,双击打开
出现的界面,和常见的安装软件并无区别,我们只需要一路“I Agree”和“Yes”下去就好~
安装完成后,打开Windows Powershell工具(Windows Power Shell_百度百科 (baidu.com))
在出现的命令行界面中,敲入blastn 或者 makeblastdb运行blast即可。
makeblastdb:blast建库命令
BLAST+中makeblastdb参数详解_likelet的博客-CSDN博客_makeblastdb
blastn:blast中核苷酸比对的命令
blastn的用法 - 简书 (jianshu.com)
先建库(makeblastdb),后比对(blastn)
大功告成~ 现在,我们可以自由的用我们的笔记本电脑开始blast分析之旅啦~
当然,还有点小遗憾,如果可以有图形化界面,支持鼠标点点的方式在windows系统操作就更好啦
关于这点,笔者目前还没有找到比较合适的工具。有好的资源,也欢迎大家随时分享啊
每一天获得一点微小的收获和进步。小确幸的科研也很好。与君共勉!
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