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什么?我可以用windows电脑玩Blast?

Blast是生物信息最最经典的工具了~

之前也和大家多次分享关于NCBI或者blast的内容

图解NCBI Blast

了不起的NCBI Blast

NCBI的blast虽然好,可是在线版总是有各种各样的限制,真正的生物信息分析大多还是使用服务器的命令行版本使用。可是,也不是所有人都会使用服务器。

那么,除了在线版 和 Linux服务器版,是否还有第三种选择吗?

有的,现在我们也可以用自己的办公电脑Windows系统玩转Blast了呢~~

具体怎么做呢?

首先,让我们下载windows版本的blast安装包。

链接如下:

https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/

链接中有非常多的压缩包,我们只需要下载红色框标注的那个~

注意!是win64.exe结尾的那个文件哦~

下载后,双击打开

出现的界面,和常见的安装软件并无区别,我们只需要一路“I Agree”和“Yes”下去就好~

安装完成后,打开Windows Powershell工具(Windows Power Shell_百度百科 (baidu.com)

在出现的命令行界面中,敲入blastn 或者 makeblastdb运行blast即可。

makeblastdb:blast建库命令

BLAST+中makeblastdb参数详解_likelet的博客-CSDN博客_makeblastdb

blastn:blast中核苷酸比对的命令

blastn的用法 - 简书 (jianshu.com)

先建库(makeblastdb),后比对(blastn)

大功告成~ 现在,我们可以自由的用我们的笔记本电脑开始blast分析之旅啦~

当然,还有点小遗憾,如果可以有图形化界面,支持鼠标点点的方式在windows系统操作就更好啦

关于这点,笔者目前还没有找到比较合适的工具。有好的资源,也欢迎大家随时分享啊


微微悦明

科学的乐趣是获得新知识的喜悦

高通量测序、大数据

病原微生物检测和监测

健康大数据行业资讯记录与分享

每一天获得一点微小的收获和进步。小确幸的科研也很好。与君共勉!

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