16S全长扩增子联合代谢组/转录组多组学研究，是目前微生态研究趋势。单一研究方法较难发表高水平文章，多组学关联研究逐渐成为“快速”发表高分paper的绝佳拍档！
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译名：转录组与16S全长扩增子联合分析热应激对鲟鱼皮肤的不良影响
期刊：Frontiers in MicrobiologyDOI：10.3389/fmicb.2022.860079全球变暖引起的热应激损害了水生动物的健康，过高或过低的水温都会导致鱼类生理功能障碍甚至死亡。热应激会影响渔业生态系统，使水产养殖的经济效益和发展受到限制。皮肤组织作为保护生物体的防御屏障起着至关重要的作用，然而，关于热应激对鱼皮的影响知之甚少，特别是在冷水鱼类中。文章使用 RNA-seq、组织学观察和16s全长多样性分析研究了90只西伯利亚鲟鱼在轻度热应激（24°C，MS）和高热应激（28°C，HS）下皮肤受到的影响。
1. 在RNA-seq中，MS vs. C组获得了8819个差异表达基因（DEGs），HS vs. C组获得了12814个DEGs，其中MS vs. C组和HS vs. C组共有3903个DEG，但只有1652个DEG 已成功注释。共享的 DEGs 在与粘蛋白合成相关的途径中显著丰富。2. 组织学观察表明，热应激显着减少了皮肤粘液细胞的数量，并引起了表皮的损伤。3. 微生物多样性分析表明，热应激通过增加潜在病原体（Vibrionimonas、Mesorhizobium 和 Phyllobacterium）和减少益生菌（Bradyrhizobium 和 Methylovirgula）显著破坏了皮肤微生物群的多样性和丰度。4. 本研究揭示了热应激对鲟鱼皮肤的不利影响，表现为粘液分泌减少和粘膜微生物群紊乱，这可能有助于制定全球变暖引起的热应激的预防策略。全文链接：https://mp.weixin.qq.com/s/_itPZtT77Hu-30WURExdlA译名：聚苯乙烯微/纳米塑料通过肠道微生物群、代谢物和细胞因子的串扰诱导造血损伤期刊：Environment InternationalDOI：10.1016/j.envint.2022.107131微/纳米塑料（MNPLs）作为新型环境污染物，广泛存在于环境和生活中，带来健康风险。之前的研究表明，NMPLs 可以穿透骨髓，但它们是否会引起造血损伤仍不确定。本文中，对C57BL/6J 小鼠通过胃内给药用MNPL处理42天。通过结合16S rRNA、代谢组学和细胞因子芯片评估了 MNPL 诱导的造血毒性和潜在机制。
1. PS-MNPLs可引起造血毒性，表现为骨髓细胞排列紊乱，集落形成、自我更新和分化能力降低，淋巴细胞比例增加。2. PS-MNPLs破坏了肠道微生物群、代谢和炎症的稳态，所有这些都与血液毒性相关，表明异常的肠道微生物群-代谢物-细胞因子轴可能是 MNPLs 诱导的造血损伤的关键途径。3. 研究系统地证明了多尺度 PS-MNPLs 通过肠道微生物群、代谢物和细胞因子的相互作用诱导造血毒性，并提供了对 MNPLs 毒性的有价值的见解，这有助于健康风险评估和有关 PS-MNPL的明智政策决策。
图 PS-MNPLs暴露对肠道微生物群和细胞因子的影响
译名：肝脏转录组和全长16S rRNA联合揭示聚氯乙烯微塑料导致肝损伤和肠道微生物群失调期刊：Science of the Total EnvironmentDOI：10.1016/j.scitotenv.2022.155984微塑料（MPs）已成为有害的环境污染物，其对生物体的潜在毒性引起了广泛关注。然而，聚氯乙烯 MPs (PVC-MPs) 对小鼠肝脏的影响及其相关机制仍不清楚。本文针对暴露于 PVC-MPs的雄性小鼠，分别对肝组织和粪便样本进行转录组和全长 16S rRNA 测序，探究PVC-MPs对小鼠的毒性机制。
1. 暴露于 PVC-MPs 的小鼠血清丙氨酸转氨酶 (ALT) 和天冬氨酸转氨酶 (AST) 水平明显高于对照组，这表明存在肝损伤，肝组织病理学变化证明了这一点。此外，暴露于 PVC-MP 后血清和肝脏的甘油三酯 (TG) 和总胆汁酸 (TBA) 水平降低。2. 小鼠肝组织RNA测序共鉴定出1540个差异表达基因（DEGs），与47条通路相关，包括脂质代谢通路、氧化应激、磷酸肌醇3激酶（PI3K）/蛋白激酶B（Akt）信号通路，这些 DEGs 在小鼠肝脏中富集。3. 小鼠粪便样本全长 16S rRNA 测序分析表明，PVC-MPs 暴露降低了益生菌的相对丰度并增加了条件致病菌的丰度。4. 慢性 PVC-MPs 暴露会导致小鼠肝毒性和肠道菌群失调，这些发现为 PVC-MPs 对人类健康的潜在风险提供了新的见解。
图 GO和KEGG注释分析pvc - mps处理组和对照组之间的基因变异
1. Yang S,Xu W,Tan C, et al. Heat Stress Weakens the Skin Barrier Function in Sturgeon by Decreasing Mucus Secretion and Disrupting the Mucosal Microbiota. Front Microbiol. 2022;13:860079. doi:10.3389/fmicb.2022.8600792. Jing J,Zhang L,Han L, et al. Polystyrene micro-/nanoplastics induced hematopoietic damages via the crosstalk of gut microbiota, metabolites, and cytokines. Environ Int. 2022;161:107131. doi:10.1016/j.envint.2022.1071313. Chen X,Zhuang J,Chen Q, et al. Chronic exposure to polyvinyl chloride microplastics induces liver injury and gut microbiota dysbiosis based on the integration of liver transcriptome profiles and full-length 16S rRNA sequencing data. Sci Total Environ. 2022;839:155984. doi:10.1016/j.scitotenv.2022.155984
