现在的海幢寺，佛境与俗世交融，落霞与佛光普照，僧人与游客朝夕相处。曾有过孩子们的喧闹，老人们的舒适悠闲，现在已变成寺院浓密的香火，这一切显出这亦园亦寺的兼容大度和祥和安谧。海幢寺除拥有寺、 殿、 堂、 塔、坊等佛教标志性建筑外， 还拥有庭、台、 楼、 阁、 轩等大众休憩庭园。既在世俗之中，也在世俗之外，这正是海幢寺与众不同之处，使更多人，包括虔诚的信众和不一定对佛有领悟的人聚在一块，和谐共存。这也正是佛的最高境界。
海幢寺发展扩大为今天的规模，跟清初三藩王之一的平南王尚可喜不无关系。据说尚可喜某日到过海幢佛堂之后，听从海幢寺住持阿字和尚的劝导，建寺竖钟，超度亡魂。于是藩王牵头，引发当时王府上下、官府内外的募捐热潮。
康熙五年 （1666）至十八年（1679）间，阿字和尚趁尚可喜等人支持，广结善缘，发动更多人募捐，集资购置寺旁四周余地，进一步扩大了寺院的规模和范围。
先是由王妃舒氏（尚可喜之妻）捐建大雄宝殿。
平南王尚可喜本人则捐资建天王殿。
总兵许尔显捐资建韦驮殿、伽蓝殿。
广东巡抚刘秉权捐资建山门。
其他人等，也不甘人后。
续后相继捐资建成的有：丛现堂（光绪四年，即1878年改为还近堂）、香积厨、大悲阁、药师佛母堂、西禅堂、镜空堂、松雪堂、幢隐庐、惜阴轩、就树轩、静观楼、闻清钟阁、地藏阁、悟闲堂、画禅堂、诸天阁、塔殿、云水堂、客堂、库房、经坊、斋堂、 持福堂、 普同塔等建筑。始初的佛堂、 准提堂也被改为客堂，环以回廊，以增壮观。
其间庙宇尽用绿色琉璃砖瓦盖顶，均由平南王尚可喜之妻舒氏布施。这是当时最为华丽名贵的建筑材料，显赫的王府也不见得使用，可见这里是用尽世间的排场。
平南王尚可喜之所以做善事，据说是因为他攻陷广州时屠城十日，亡者数以万计，所到之处，几乎是清市清巷，尸横遍地，珠江水面血流成河，河水终日不清，阴霾污浊不散，成为广州有史以来最大的劫难，尚可喜因而也噩梦连连，终日不得安宁。后来他到佛堂和住持阿字和尚见面后，始有所悟，想为自己所作之事做些弥补，于是听从住持的劝导，牵头扩建海幢寺，以超度亡魂，祈求心理安慰。
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