灼口综合征的主要病因与局部病变、全身病变和精神因素相关，好发于更年期女性、糖尿病患者等人群。灼口综合征一般都是自发的，没有明显诱因。

1、局部病变：
（1）接触性过敏，常见于食物或口腔义齿及口腔填充材料中很多成分可以作为过敏原引起疼痛感。
（2）义齿，可能由于戴义齿的适应性过程中，舌部空间少，咬合位置不适合及垂直距离增加有关。但也有人认为烧灼感不过是由于义齿在口腔黏膜上简单摩擦所产生的副作用。
（3）感染，最常见的是真菌感染。
（4）局部刺激因素，如牙石、残根、残冠、锐利的牙齿边缘、不良修复体等均可引起，口腔修复体中不同金属间产生的流电刺激也是局部刺激因素之一。