如何在CNGBdb存储代谢组数据？ | CNGBdb-Question Time

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代谢组+16s/宏基因组“CP”备受各顶刊青睐，已发文领域：植物、医学、环境生态等。

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01:35

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大佬Dr.羊

君君，代谢组和宏基因组的数据可以同时保存在CNSA吗？

嗯嗯，当然可以，CNSA提交入口：实验/测序板块可以提交宏基因测序数据；代谢板块可以提交代谢组数据。

我的代谢组数据是用NMR技术做的，符合存储要求吗？

符合，CNSA可以存储气相色谱-质谱（GC_MS）、液相色谱-质谱（LC-MS）、核磁共振（NMR）技术检测的代谢组数据。

点击阅读原文，提交数据吧！

#如何在CNGBdb存储代谢组数据？#

2020年7月31日，国家基因库序列归档系统（CNSA）新增代谢组学数据的归档功能，包括代谢组学研究的设计、方案、试验、样本等元数据和原始数据文件。

# 代谢组数据递交流程：在提交代谢组数据之前，请先创建项目和样本

01

代谢组递交入口

在提交入口页点击“代谢”进入提交流程。

02

提交代谢组数据文件

CNSA接收多种格式的数据文件，例如RAW、ZIP、JDX、CDF、WIFF、JCAMP、TXT等。根据数据文件格式要求和数据上传方式上传数据文件。

03

提交代谢组元数据

代谢元数据包括描述信息和试验信息。

3.1 提交描述信息

描述信息是对研究的设计、因素、方案等信息的描述，可通过模板进行提交。

操作指引：下载描述信息模板（Template_Metabolism_Descriptions_MS_NMR.xlsx）→ 填写 → 上传。注意：描述信息必须提交。

系统将依次校验提交文件中的每个表，如果字段校验不通过，请根据弹框提示的校验规则和错误行号进行修改，然后重新上传。

3.2 提交试验信息

试验信息是对研究代谢物和试验仪器参数等信息的描述。目前CNSA可以提交使用质谱和核磁共振技术的试验信息，提交模板有以下三种：

• Template_Metabolism_Assay_GC-MS.xlsx用于递交使用气相色谱-质谱（GC_MS）技术的试验信息。

• Template_Metabolism_Assay_LC-MS.xlsx用于递交使用液相色谱-质谱（LC-MS）技术的试验信息。

• Template_Metabolism_Assay_NMR.xlsx用于递交使用核磁共振（NMR）技术的试验信息。

操作指引：描述信息上传之后才可以新建试验。点击“增加试验”创建一个试验 → 选择/下载相应试验模板 → 填写 → 上传。

如果字段校验不通过，请根据弹框提示的校验规则和错误行号进行修改，然后重新上传。注意：需要至少创建并提交一个试验。

04

数据文件MD5值校验

元数据校验通过后，系统将对数据文件进行MD5值校验。可在”数据文件状态”模块查看数据文件状态，如果有未通过校验的文件，请点击“查看”并根据弹框中的提示信息做相应处理。

05

个人中心查看递交结果

当数据文件的状态为“校验完成”时，请点击“提交”，系统会自动分配代谢编号（METMXXXXXXX），并在10秒后跳转到“我的提交-代谢”，可在此页面“元数据状态”列查看代谢数据编号或下载元数据文件。

CNGBdb-Question Time是国家基因库大数据平台公众号全新策划的栏目，用提问的方式告你CNGBdb的正确使用方式，每周三更新。欢迎大家通过推文留言区、公众号后台、听课君微信告诉小编，你对CNGBdb的任何疑问，你的提问留言将在此栏目做解答哟！

本期供稿：CNGBdb 郭学芹

Dr.羊&听课君图片原创：CNGBdb 魏晓锋

编辑：尐尐呅