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Helix和U.S.CDC继续合作,监控包括COVID-19在内的泛呼吸道病毒

全球视野,深度视角

各位亲爱的股东朋友们,大家早上好。

让我们继续昨天的话题,虽然很多人其实不感兴趣,个人觉得这种项目的意义还是不小的,因此各位忍忍。

再次感谢各位股东的转发、点赞、收藏、在看,也继续欢迎各位股东后台留言,或者<pilotofstars@proton.me>邮件联系。

先看新闻

2022年12月15日,Helix宣布与U.S. CDC加深双方的合作,将联手打造泛呼吸道病毒监控项目(注1)。

据悉,CDC将向Helix提供500万美元资金,使用该公司的呼吸道病毒测序panel(Viral Sequencing Respiratory Panel,VSPP)建设呼吸道病毒监控系统,这将对呼吸道病毒的传播起到早期预警的作用。

VSPP可以检测/鉴定超过30种呼吸道病毒变种,包括SARS-CoV-2,流感病毒,RSV(呼吸道合胞病毒),rhinovirus(鼻病毒)等,全年将检测至多16000份样品。

Helix将于HealthPartners/ Providence这两家健康服务提供商一起合作,链接多个分中心。

同时Helix将标准化样本选择、知情同意、运输和报告处理等工作,建立基础设施对此进行支持。

通过数据的回传、预警各个分中心,协助这些分中心进行决策。

而Helix跟CDC的合作也不是第一次了,早在2021年Helix就和Illumina一起合作来跟踪SARS-CoV-2(COVID-19)的变异情况。

今年9月20日,CDC刚与Helix续签了合同,该项合作将使得Helix获得一项每周测3000 例SARS-CoV-2样本/周的合同(注3)。

这项合作将持续一年,并且可以根据需求Double样本数量。

那么,这种项目的建设意味着什么呢?

变异监测与预警

显然,这对病毒变异的监测与预警有着至关重要的作用。

在早些时候Helix发布的一篇名为《Top Viral Surveillance Insights: Why there may be a 'twindemic’ this winter》的文章中(注4),该公司通过对流感和SARS-CoV-2的监测发现,近期(10月份)18岁以下的COVID-19检测阳性率从>30%下降到~10%,而流感病毒阳性率则从<1%提高到~10%。

(谁能把这个作图的人揍一顿。。。那个图例。。。。)

这基本上预示着美国本土的冬季新冠和流感的双流行极有可能无法避免。

当然,这种级别的预警还不够,Helix通过对病毒变异毒株的测序,能够更精细的刻画不同毒株的流行情况。

比如上图中,能够非常明显的区分不同COVID-19毒株的传播趋势。

而通过不同毒株的测序,能轻易的对不同的毒株突变进行区分。

分析发现,BQ.1.1/BQ.1均携带K444T突变,使得其能够逃逸对BA.5/BA.2的免疫。

且BQ.1.1还有另外一个R346T,能够更好的逃逸对BA.2的免疫。

而类似的报告,Helix每个月会发布2次。

这种报告,对于指导防疫政策,提醒公众防护有着非常重要的作用。

在这点上,我国相关基础信息的建设也是有的,只不过在公共层面的感知并不强。

国内的COVID-19监测

根据《新型冠状病毒肺炎防控方案》第九版附件中《新冠肺炎监测方案》的要求,对境外的标本是要进行全基因组测序的,还有一些本土病例的监测。

同时对变异毒株的监测也是有覆盖的,包括我国新发及其他地区的VOI/VOC。

此部分工作大都由疾控部门负责,向国家疾控中心报告。

公众对此部分信息获取可能性极低,这就造成了后续如果大范围传播,群众的日常行为决策缺乏指导依据。

因此建立国内类似的病毒传播监测系统是必要的,如果能够采用PPP模式,最大限度的利用已有公司的相关资源,也不失为一种高效的手段。

Helix

Heli是一家提供基于测序的健康服务提供商,成立于2015年7月15日,创始人是James Lu, Justin Kao和Scott Burke。

目前看起来就剩下Dr. Lu在公司了,目前任CEO(印象中好像还有2个CEO,Robin和Marc)。

Dr. Lu本/硕毕业于斯坦福大学,后进入贝勒医学院拿了MD/PhD。

后来先后去了默克/伦敦大学/杜克大学做研究工作,最终2015年创立了Helix。

公司成立之初,其设计理念是向广大用户收集DNA,之后对这些基因进行测序、分析,将这些分析结果进行储存,让用户能获取自身的基因组信息,用以回答用户所提出的问题或为用户提供不同app。

是不是感觉有点像23andme?

而事实上也确实如此,当年Helix将平台上的产品分为4大类:祖源、健康、个人管理、以及娱乐,并且可以通过DNAstore的应用程序选择不同的分析产品,妥妥的消费基因检测公司配置。

公司2019年开始对公司经营策略进行了调整,开始为卫生系统、支付方以及对群体健康基因组学感兴趣的研究人员提供全套测序解决方案和服务。

值得注意的是,一开始Helix就是Illumina的spin-off,时至今日Illumina的财报中也会出现Helix的公允价值变化的信息。

但是经过3轮融资之后,Illumina所占股权比例是多少就不知道了。

目前,Helix已经融资超过4亿美元。

这是不是可以提示下国内各位在mNGS深度内卷的玩家,有没有可能尝试下PPP模式?

(完)

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