科研工具 | R语言第1期. 听说你因为不会安装R包而放弃入门R语言？

你是否曾为安装一个R包苦苦摸索？你是否因为R包无法安装导致学习R语言从入门到放弃？今天我们就把R包安装的方式统统告诉你！

我们今天将介绍R包安装的3种方法：

install.packagesBiocManager::installdevtools::install_github()

学会这3种方法之后，你应该可以成功安装绝大部分的R包，发车~

方法1：install.packages（"R包名称"）

已常用的ggplot2包为例：

install.packages('ggplot2')

·    Tips: 在安装时，R包名称必须加上引号哦（英文单引号）！

·    使用该种方式安装的R包来自R语言官网

·    安装过程若有红色提示，不用慌张，只要没有error提示，就没问题

然而有时候这种方法并不靠谱

比如：

·    安装FlowSOM包时，提示并不存在这个包。此时就需要尝试以下方法

方法2：BiocManager::install（"R包名称"）

if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))  install.packages("BiocManager")  BiocManager::install('FlowSOM')

·    使用该种方式安装的R包来自Bioconductor（该网站有大量生物信息学相关R包）

·    在安装前需要先加载BiocManager这个包，第1、2行代码表示，如果未安装BiocManager，则先通过install.package()进行安装

方法3：devtools::install_github("库名/R包名")

library(devtools)install_github("jokergoo/ComplexHeatmap")

·    使用该种方式安装的R包来自github（是一个开源的代码的云端），可以去github官网（https://github.com/）搜索R包名称，就会出现该R包对应的库名

·    一般语言使用者可以将自己编写的函数放在github网页上供其他人使用

    看到这里，恭喜你已经在入门R语言的路上啦！我们后续会继续更新基础及临床科研相关的R语言实战经验分享，敬请期待~

       写在最后

“Meddingguan”是由一群北京协和医学院（清华大学医学部）的博士开创的公众号，与B站“开心doctor”一脉相承，初心是让医学科研有迹可循，帮助一线的医学科研人员更快地成长，希望大家支持与关注！