1901年，慈禧太后的脖子上长了个大毒疮，又痛又痒，太医们都来给她看过了，可就是没有一个人知道该怎么治这种病，气得慈禧骂这些太医，都是没用的东西。
眼看这个毒疮越长越大，还发出了难闻的臭味，慈禧倍受折磨，每天难受得站也不是，坐也不行的，她只能趴着睡觉，实在难受厉害了就让宫女给她擦拭一下，伺候她的宫女吓得战战兢兢，稍微弄疼了慈禧，就被拉出去打一顿。
慈禧的贴身太监李莲英在想，长期这样下去可不行，这老佛爷天天难受得呲牙咧嘴，身边的人都变成了她的出气筒，说不定哪天谁再惹了她不高兴，可能性命都得丢了。
李莲英左思右想不知如何是好，他认为当前重要的事就是让慈禧老佛爷的病好起来，可是太医们都看过了，个个束手无策，那只有到民间去碰碰运气了，看看有没有医术高手能治老佛爷的病。
李莲英四处打听，终于找到了一个名叫禹会元的郎中，此人医术甚是精湛，民间都称他是“华佗在世”，只是他不但会给人看病，还会给动物看病，李莲英想，如果让一个兽医去给慈禧看病，要是让她知道了，非掉脑袋不可。
可是又打听不到其他医术好的人，那就凑合得用他吧，万一能治好了呢，李莲英带着禹会元进宫之前再三叮嘱他不能透露自己给动物看过病，不然都得脑袋搬家。
禹会元还没有见过慈禧，但他听说过慈禧的厉害，所以吓得腿都发软，万一出了什么差错，可能会株连九族的，他吓得不敢再往下想了，可君命不可违，只能壮壮胆子去吧。
禹会元到了慈禧寝宫先行了大礼，然后就开始给慈禧看病，他伸过头看了一眼慈禧的脖子，吓了一跳，毒疮已经又扩散到旁边，另外又长出了一个，他冷静了一下对慈禧说，：“这个病可以治，但是需要一种特殊的药材，我得回家去取”。慈禧以为禹会元想要找个借口逃跑，于是气呼呼地说“你是不是不想给哀家治啊”？李莲英见老佛爷生气了，赶紧上前打圆场，他凑近慈禧耳边说：“老佛爷 不如就让他回去拿药吧，量他也不敢耍什么花招”。
慈禧答应了禹会元回家取药的要求，但是不放心，派了两个侍卫跟着他，禹会元匆忙回到家中取了两个罐子，然后向一片稻田赶去， 到了田边他挽起裤腿，他脱了鞋就往田里走，惊得俩侍卫面面相觑，以为他想逃跑呢，禹会元说：“放心吧，我一会就出来”。
不一会禹会元就抓到了好多蚂蟥和蛆虫，然后把它们分别放在了两个罐子中，紧接着抱起罐子就赶紧往皇宫奔走。
到了皇宫以后，慈禧正难受得团团转呢，他对慈禧说：“老佛爷 ，请您让所有人都出去吧，我这个手艺不外传的”，慈禧想，这人事真多，于是一挥手，屏退了旁边的宫女，李莲英不放心，他没有出去。
禹会元对慈禧说，“老佛爷，我给您治病的时候，您千万要闭上眼睛，不然这药就不灵了，慈禧为了能赶快治好病，此时说什么也得答应他。
等慈禧闭好眼睛后，禹会元拿出一只蚂蟥放在了慈禧的毒疮上，蚂蟥闻到了脓疮的味道拼命往里钻，慈禧觉得很是痒痒，想要用手去抓，禹会员赶紧拦住说“老佛爷，千万不能去抓，不然就白费力气了”，李莲英上前看了一眼着实吓了一跳，他差点喊出来，禹会元给他使眼色，让他冷静。
过了一会，忽然觉得，毒疮不再痛，也不再痒了，反而有一种凉凉的感觉，脖子都轻松了很多，慈禧露出了很享受的表情，李莲英看着慈禧他松了一口气。
禹会元又一只一只把蚂蟥放在了毒疮上，这些蚂蟥吃完毒疮后一个个鼓溜溜地钻了出来，禹会元把它们都收起来，又把蛆虫放上去，原来他是让这些蛆虫去吃毒疮留下的腐肉，等到腐肉被蛆虫吃尽，他彻底清理了毒疮，然后给慈禧敷上草药，慈禧感觉舒服多了。
没有多久，慈禧的毒疮就好了，与此同时禹会元还给慈禧敷过几次去疤痕的药物，慈禧拿来镜子左照右照，开心极了，脖子恢复得像从前一样，一点疤痕没留下。
慈禧对李莲英说，快把给哀家治病的神医召来，哀家要重重赏他！禹会元见到慈禧后，慈禧大喜，她说：你治好了哀家的病，哀家赏你白银千两，还要给你个官做做，禹会元赶紧跪下谢恩，他说：“感谢老佛爷的恩典，草民不要钱，也不要做官”。
慈禧急了，她说你啥也不要，哀家怎么报答你呢？那哀家就赐你四个字：“御医神手”！然后慈禧就让人把字裱好送给了禹会元。
禹会元也曾经考取过功名，但是他深谙官场的各种黑暗，所以就辞官行医了。他一生淡泊名利，更不会因为慈禧赐给他的虚名而自傲，在之后的日子里，他依然过着治病救人的平静日子。
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