Python 读取大文件

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Python 读取文件一般可以使用 read()，readlines()，但这两种方法在读取大文件时都会存储内存缺陷。

1. read() 接口的问题

f = open(filename, 'rb')f.read()

我们来读取 1 个规模为 3Gb 大小的文件，如人的参考基因组序列（hg19.fa）。read() 方法执行的操作，是一次性全部读入内存，显然会造成：MemoryError，也即会发生内存溢出！

2. readlines() 接口的问题