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自噬研究:快到碗里来!

最近自噬的研究都很火,耐药不耐药,凋亡不凋亡的都开始往上扯了。


这篇文章的题目是:'Ulinastatin Reduces the Resistance of Liver Cancer Cells to Epirubicin by Inhibiting Autophagy',基本上可以作为入门级自噬研究的参考模板了。



文章思路是这样的:首先文章证明了EPI能诱导肝癌细胞自噬,而UTI能抑制这样的自噬;然后UTI能促进EPI诱导的细胞凋亡;接着证明UTI是抑制自噬从而促进了EPI诱导的凋亡;然后证明了UTI是通过NF-kB信号通路起到了这样的作用;最后做了一下成瘤实验。


我们就看第一个Fig,就基本能了解自噬他们究竟做了点啥。


自噬研究基本可以分这样几个层次:


1.证明自噬参与了你的研究表型:western检测LC3,p62;LC3双荧光测细胞自噬流;电镜观测自噬;



自噬形成时胞浆型LC3(即LC3-I)会酶解掉一小段多肽,转变为(自噬体)膜型(即LC3-II),LC3-II/I比值的大小可估计自噬水平的高低。



但LC3的抗体会对LC3-II有更高的亲和力,所以往往会造成假阳性。所以通常会使用LC3的亚细胞结构定位来辅助实验。比如这篇文章所采用的就是HanBio Inc.(汉恒生物)的mRFP-GFP-LC3的腺病毒进行分析的。




2.证明自噬在你的表型中起了关键作用:加自噬抑制剂3-MA,激动剂rapamycin等,然后检测表型(功能);



这里就用到了两种自噬抑制剂:3-MA和CQ(Chloroquine)。


3.找到表型与自噬衔接的分子:检测自噬通路如pI3K 通路,Beclin-1,ATG家族各成员,看看哪个与表型呈现正相关变化;



4.基因操作3中的分子,检测自噬和表型:说明该分子在衔接自噬和表型中的作用机制;


这一点需要运用到的也就是柯霍氏法则回复实验


…华丽丽的分割线…


李莫愁博士:而普通的自噬研究,也就是这样一个模式:(感谢汉恒生物的蔡博士为我们整理



自噬表型研究中,较为常用的就是采用汉恒的mRFP-GFP-LC3融合蛋白的腺病毒,对细胞进行了感染。mRFP 用于标记及追踪LC3,GFP 的减弱可指示溶酶体与自噬小体的融合形成自噬溶酶体,即由于GFP 荧光蛋白对酸性敏感,当自噬体与溶酶体融合后GFP 荧光发生淬灭,此时只能检测到红色荧光。


就像是这样:


2014,Kidney International,IF=7.916

该实验所用自噬工具为汉恒生物Ad-mRFP-GFP-LC3双标腺病毒


好啦,今天就策到这里了。



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