清热解毒药的排头兵连翘，在《神农本草经》中首载有“主寒热”的功效。而医圣张仲景《伤寒论》里的麻黄连翘赤小豆汤，则首开经方、成方用连翘治疗外感热病之先河。但自汉代之后至宋代的较长时期内，应用连翘来治疗外感热病，却相对较少。直到明末清初，中医温病学派形成完整体系，方使得连翘被广泛应用于温病甚至疫病（疫疠、瘟疫）的治疗。
连翘功专清热，单味作用很显著，与他药组成药对效果更好。以下是三组最常用的连翘清热药对。
金银花、连翘：清热解毒，专治实热
连翘与金银花配伍，在中药清热配伍中最为常见。连翘轻清上浮，善走上焦以泻心火，破血结，散气聚，消痈肿；金银花质体轻扬，气味芳香，既能清气分之热，又能解血分之毒。二药合用，并走于上、轻清升浮宣散，清气凉血、清热解毒的力量增强。主要用于温病初起、外感风热表证、风热痒疹、疮痈肿毒、风热头痛、咽喉肿痛、疮痈肿毒等症。
清代温病大家吴鞠通擅用金银花、连翘药对，在其著作《温病条辨》中用到两药的代表方剂有银翘散及其加减方、新加香薷饮、银翘马勃散、银翘汤等，用于治疗临床表现各异而实质属热的病证，为临床应用金银花、连翘提供了示范。含有此药对的现代中成药，就有著名的连花清瘟胶囊和金花清感颗粒，根据中医学辨证论治法则，它们可主治现代病毒性传染性外感疾病。
栀子、连翘：清热凉血，侧重清心泻火、凉血解毒
连翘味苦微寒，质轻而气浮，能透达表里，长于清心火，实为泻心要剂。心为火主，心清则诸脏与之皆清，又能凉解上焦之风热；栀子苦寒降泄，善能泻火泄热，又有凉血解毒之功，外解肌肤之热，内清心肺三焦之火，统治三焦诸经之郁火。二药皆为苦寒之品，配对使用，共奏清心除烦、凉血解毒之功，尤宜用于温病热入心包之证，还可用于口舌生疮、尿赤短涩、疮疡肿毒。总之是从上引下的。
运用栀子、连翘配对组方的凉膈散（出自《太平惠民和剂局方》）有泻火通便、清上泄下功效。至元代朱丹溪，既运用本方治胃火上蒸之自汗，也用于治风热上攻之耳聋。
用于清泄心火之时，有幸共事过的老前辈周凤悟先生特别推荐精选连翘心。他在《实用中药学》中强调：“（连翘）籽实为‘连翘心’，更长于清心热，以治邪陷心包、神昏谵语之症。近据报道，连翘心具有中枢兴奋作用，故温热病神昏谵语时可用……连翘心还有健胃、止呕作用。”
麻黄、连翘：清热达表散邪
连翘清热解毒，麻黄疏表散邪，二者相配，有疏表清热解毒之功。著名成方就有《伤寒论》麻黄连翘赤小豆汤，它是用来散瘀热的，用治“瘀热在里”，发而散之。著名伤寒学家郝万山以医案为例讲解麻黄连翘赤小豆汤的运用，他最终悟出此方的药证有“脉浮主表”一条，此方正是“表而发之”的解表治法。在麻黄、连翘配伍的基础上，若加上赤芍活血祛瘀，甘草清热解毒，可治过敏性紫癜。
2010年起曾参与国家第三批中医药古籍整理课题，完成了对《医镜》与《药镜》的整理。其中，清代蒋仪的《药镜》对连翘的功效有所发挥：“连翘：辛散苦泄，轻扬上行。解六经肿毒寒热，治百种疮疡疼痛。通月事，疗五淋，消痘毒，杀白虫。利小便而降心经之火，退诸热而清脾胃之湿。从山栀则引热内降，从麻黄则引热外散。”这对理解连翘的后两个药对很有实用价值。“从内”与“从外”，“内降”与“外散”，两个药对的协同，作用趋向有所不同：连翘配伍栀子，二者虽有散发之性不令内闭，但重在引热内降，令全身热毒从小便而排出；麻黄配伍连翘，二者重在引热外散，可令全身热毒从皮肤而外排。湿热毒邪令皮肤黄疸，麻黄连翘赤小豆汤恰好治之，仅从主药的“麻黄、连翘”药对就很容易理解了。
《伤寒论》最先提出的“瘀热在里”，若与麻黄连翘赤小豆方主治中有黄疸的表现相联系，当是指阳明之热，因无汗不能外越，加之小便不利，水湿内停，热受湿困，瘀积在里，湿热郁蒸，导致发为黄疸。“瘀”是积滞停留之意。“瘀热在里”，也可指热与瘀血在体内相聚集的情形，即指某些病变导致体内的瘀血停留，引起发热。新冠肺炎的部分临床表现，也显示有“瘀热在里”的病机。连翘有“退诸热而清脾胃之湿”的功效，也常用于病毒性流行性疾病的治疗，在治疗新冠肺炎的多个方剂中都可以见到。
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