口腔溃疡的直接病因有二：火升与气不升。
火升就是上火，上火就是有炎症，有炎症就容易损伤皮肤粘膜。口腔粘膜损伤就发口腔溃疡。其常伴有口气，口苦，口干，牙龈肿痛等症。治疗用三黄泻心汤。不过单纯火升引起的口腔溃疡比较少见所以临床用清火消炎治疗效果并不好。
气不升就是人体原气升发无力不能运行至上部。人体正常细胞损伤必须要靠原气运送营养精微物质来修复，所以当气不升时口腔粘膜一有损伤而难以修复则易发为溃疡而不易愈。引起口腔溃疡之气不升多为脾气不升，脾气不升多有脾胃不好的症状如食少便稀等，治疗用理中汤 补中益气丸等。少阳气不升亦会引起口腔溃疡，因少阳经亦行口腔耳。少阳气不升多伴有眼干眼易疲劳记忆力减退等症。治疗用小柴胡汤加味。
临床火升与气不升两因常同时存在，火升损伤粘膜，气不升抗邪无力修复无权，单治一因常难根治。如脾气不升与火升所致溃疡用甘草泻心汤疗效极佳。少阳气不升与火升用小柴胡汤加黄连治之。
气不升常由他病引起，如胃肠病易引起脾气不升。生殖系病，肝胆病，肾病易引起少阳气不升。治疗应以治原发病为主。原发病治愈溃疡可自愈。
