春秋战国时期，楚州先后属吴、越、楚等诸侯国。秦统一后建淮阴县，楚州部分地区属淮阴县。楚汉之际，属项羽西楚。汉高祖五年(前202年)，封韩信为楚王，楚州属楚王国。西汉武帝元狩六年（前117年）设县，名射阳。东晋义熙七年(411年)设山阳县同时设山阳郡。南北朝齐永明七年(489年)设淮安县。隋开皇三年（583年）设楚州，治淮阴。南宋初，金兵南侵，韩世忠屯兵八万于山阳县，如老熊当道，而淮东得以安寝，遂于绍定元年（1228年）升楚州为淮安军，改山阳县为淮安县。元复名山阳县，元至元十四年（1227年）设淮安府路。元至正二十六年(1366年)朱元璋改淮安府路为淮安府，治山阳。清雍正九年(1731年)，析淮安府山阳、盐城2县地置阜宁县。
民国元年（1912年）裁淮安府，山阳县直属于省。民国三年（1914年）山阳县改称淮安县，属淮扬道。
1950年3月，淮宝县裁撤，其部分辖地归淮安，淮安县属盐城专区。1954年8月淮安县改属淮阴专区。1970年，淮阴专区改为淮阴地区，淮安县属淮阴地区。1983年3月，撤销淮阴地区，清江市更名为淮阴市，改由省直辖，淮安县隶属淮阴市。1987年12月22日，撤销淮安县，设立淮安市（县级）。2000年12月21日，淮阴市更名为淮安市；同时撤销县级淮安市，设立淮安市楚州区（2001年2月正式实施），2012年1月31日，淮安市楚州区更名为淮安市淮安区。
淮安区历史悠久，是国务院第二批命名的全国历史文化名城。 从东晋到明清，淮安区一直作为郡、州、路、府的治所。明清两代是漕运总督部院所在地，曾与苏州、杭州、扬州并称为大运河沿线上的"四大都市"。淮安区集名人、名胜、名著、名菜于一身，自古人杰地灵，人才辈出，是全国四大菜系之一的淮扬菜系的发源地之一。
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