1952年下半年,教育部在全国进行了大规模的高等学校院系调整工作。这次调整涉及100多所高校,主要是把一些大的大学分解成为一些小的学校。北方交通大学建制撤消，唐山工学院改为唐山铁道学院，清华大学土木系助教2名和学生6 名，哈尔滨铁道学院土木系及重庆大学铁道工程组学生调入该校，而该院各系调往其他学校及人才损失情况（这里注明院士的，均为之后当选）简介如下：
1）建筑系调15教师（教授6名，副教授4名，讲师3名和助教2名）和全部学生先到北京铁道管理学院，然后调至天津大学：调出的教师及学生有徐中教授、刘福泰教授、沈玉麟教授、卢绳教授及彭一刚院士、周祖奭教授等。
2）冶金系连同所有师资学生，设备，图书等，主要调整到新组建的北京钢铁学院（今北京科技大学）：调出的教师及学生有徐祖耀院士、吴自良院士、王钧豪教授、王绍瀛教授、张万奇教授、章守华教授、林宗彩教授、朱觉教授、马如璋教授、王润教授、葛昌纯院士等及物理系赵松鹤教授。
3）采矿系除地质组外全部调往中国矿业学院（今中国矿业大学）：调出的教师及学生有何杰院士、张熙年教授、陈清如院士、江山寿教授、张荣曾教授、汪泰葵教授、王祖讷教授等。
4）采矿系地质组调整到北京地质学院（今中国地质大学）：调出的教师有王鸿桢院士、袁见齐院士。
5）土木系水利组调整到清华大学：调出的师生中有著名科学家黄万里教授以及王三一院士。
6）化学工程系除保留应用化学组外，其余14名教师（教授和副教授各4名，讲师1名，助教5名）和54名学生调整至天津大学：包括余国琮院士。
7）材料工程系调入北京铁道学院：严东生院士由于唐院材料系撤销而去了中科院上海冶金陶瓷研究所。
8）电机系电讯组调整到原哈尔滨铁道学院然后又调至北京铁道学院。
经过以上调整，唐院共调出教师72名（其中教授22人，副教授11人，讲师4人，助教35人），其中不乏著名学者。另外，本院中外文图书、刊物调往天津大学691册，调往中国矿业学院1777册，调往北京地质学院292册，调往哈尔滨铁道学院81册。
50年代初，该校在北京潭拓寺建立了唐山铁道学院北京分校，后成为铁道部党校。
我校一直受开滦煤矿底下采掘的影响，遂在甘肃兰州选址谋迁。1958年初建成了部分校舍，成为唐山铁道学院兰州分校。后来为了在华北地区保存一所名牌高校，国务院决定该校不迁兰州。为了适应党中央开发建设大西北对铁路运输专门人才的需求，我校报请国务院批准，把兰州分校改为兰州铁道学院。随后，该校的铁道建筑、桥梁与隧道工程内燃机车、铁道车辆、铁建系给排水专业、电气运输系以及北京铁道学院的运输系（一部分）成建制地连同师资，学生，实验设备及图书资料搬迁至兰州。
1964年，为支援大三线建设，国务院决定:唐山铁道学院内迁至四川省峨眉县。1971年底，学校正式迁到峨眉，改名为西南交通大学。
1989年学校校部正式搬迁至成都，从而形成了成都、峨眉两个校区。
2000年2月12日，西南交通大学由铁道部正式划归教育部。
2004年，西南交通大学在成都郫县犀浦镇建成新校区——西南交通大学犀浦校区，“一校两地三校区”的格局正式形成。
