后基因组时代你还跟得上吗？

套路帝Dr.S有段时间没和大家唠嗑了。这段时间Dr.S痴迷于蛋白质组学的研究无法自拔。说到组学研究，大家都会不自觉的把组学和基因组连在一起，所以组学就等于测序。

在这种大无畏精神的鼓动下人类首先把自己的基因组给测了一遍。

接着又把所有植物，动物都挨个测了个遍，在科学家们不断的努力下，连北极熊，企鹅都没能逃过测序仪的魔爪。

但是，十几年过去了，等我们把物种，疾病都给测完了以后学术界出现了一阵恐慌：我们还能研究什么？

2007年的时候，耶鲁大学的John R Yates III（叶芝三世）教授发现了一块新大陆，他说蛋白质组学将会是今后科学问题的制造引擎（hypothesis-generating engine）。

到了2014年五月，Nature上同期刊载了两篇人类蛋白质组的研究工作：

1. A draft map of the humanproteome

2. Mass-spectrometry-baseddraft of the human proteome

两篇文章其实说的是一个事情，就是测序做到头了，人类进入了后基因组时代了，大家以后就开始玩蛋白质组吧。

中国科学家在这方面绝对是走在了世界的前头，由贺福初院士牵头的中国人类肝脏蛋白质组计划是和美国人类血浆蛋白质组计划并驾齐驱的两大工程。这几年使用蛋白质组学技术中标的国自然数量和文章发表情况都是逐年猛增。

蛋白质组学技术目前流行的几种手段包括iTRAQ/TMT，SILAC，Label Free等都是属于同一类技术，叫做数据依赖性的扫描模式（data-dependent acquisition，DDA）。大致原理是通过蛋白质样品消化成肽段，离子化并通过质谱进行分析。在全扫描质谱图中，高于噪音的肽段信号被选择性裂解，产生随机（MS/MS）质谱，能够与数据库中的图谱相匹配。尽管这种方法非常强大，但是它随机抽取肽段进行裂解，对于我们最喜欢的转录因子，膜蛋白，激酶等蛋白类型的检出效果不佳。

在此基础上开发的数据非依赖性扫描模式（data-independent acquisition，DIA）技术是新一代的蛋白质组学技术。可以依次对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子信息进行蛋白定性和定量。将所有样本中的蛋白质信息以数据形式保存，方便后续各类分析。

“

DIA有更高的覆盖率

DIA技术重复性更高，数据记录更完整

DIA技术定量更加准确

”

最最重要的是DIA方法可以把放在冰箱里的珍贵样本以数字化形式保存供我们反复挖掘，妈妈再也不怕我辛辛苦苦收集的宝贵样本降解了。

样本降解猛于虎也

最近发表的文章发现血浆样品在室温保存48h就至少会有4%左右的蛋白被降解。长年累月的把血样放在保存条件很差的冰箱里的读者们，你们的小心肝颤抖了吗。快快把样品转化成SCI文章吧。

使用DIA技术的高分文献Dr.S也为大家做一个解析：

大家觉不觉得如果这些研究再增加细胞或者动物模型完全都可以再进行深入的基因功能和机制验证从而发表超20分的文章呢。Dr.S觉得临床相关的科学研究万变不离其宗，都是可以沿用下面这个公式的：组学筛选基因相关基因——高通量验证组学筛选到的基因——功能验证——机制研究

期待着小伙伴们能够在后基因组时代不被拉下，勇发高分SCI。

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