2012年12月27日，国家税务总局颁布了《关于印发<跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法>的公告》（国家税务总局公告2012年第57号）（以下简称“《办法》”），此文件涉及的部分政策变化以及常见问题：
答：《办法》共三十三条，分为总则、税款预缴和汇算清缴、总分机构分摊税款的计算、日常管理、附则等五部分。具体来说：
第一章：总则（共五条）。主要包括立法依据、适用范围、总体管理办法等规定，解决了《办法》中一般性和总括性的重要问题。
第二章：税款预缴和汇算清缴（共七条）。主要包括税款分配基本格局、预缴申报和汇缴申报的内容，属于汇总纳税企业所得税征收管理中的征收部分，突出了汇缴申报中分支机构分配表（第十一条）的作用，明确首次预缴申报时报送分支机构上一年度的年度财务报表（或年度财务状况和营业收支情况）（第九条），以利于相互比对，也有利于就地启动税务检查。
第三章：总分机构分摊税款的计算（共八条）。概括了总机构、分支机构计算分摊税款的全过程，与28号文件相比，这一计算过程更加完整和系统，突出强调了总机构计算公式（第十三条）、分支机构计算公式（第十四条）、分支机构“三因素”所属区间（第十七条）、总分机构不同税率情况下的计算（第十八条）和计算错误的处理（第二十条）。
第四章：日常管理（共十一条）。初步搭建了一个涵盖税务登记信息沟通、二级分支机构判定、挂靠机构处理、资产损失管理、税收优惠管理、税务检查（税款计算、分配、信息沟通）、信息平台建设和维护、总分机构主管税务机关划分、征收方式鉴定等较为系统的日常管理体系。突出了沟通与协作的重要性（第四章），强调了就地监管机制中“二级分支机构判定”（第二十三条、二十四条）和“就地检查”（第二十七条、二十八条）的管理抓手作用。
——摘自国家税务总局关于《印发〈跨地区经营汇总纳税企业所得税
征收管理办法〉的公告》的解读
2、汇总纳税的分支机构是否需要进行年终汇算清缴？
答：《办法》第十条规定，汇总纳税企业应当自年度终了之日起5个月内，由总机构汇总计算企业年度应纳所得税额，扣除总机构和各分支机构已预缴的税款，计算出应缴应退税款，按照本办法规定的税款分摊方法计算总机构和分支机构的企业所得税应缴应退税款，分别由总机构和分支机构就地办理税款缴库或退库。
汇总纳税企业在纳税年度内预缴企业所得税税款少于全年应缴企业所得税税款的，应在汇算清缴期内由总、分机构分别结清应缴的企业所得税税款；预缴税款超过应缴税款的，主管税务机关应及时按有关规定分别办理退税，或者经总、分机构同意后分别抵缴其下一年度应缴企业所得税税款。
因此，与旧政策不同，汇总纳税的分支机构需要按规定进行年终汇算清缴。
3、新政策中对分支机构计算分配比例的三项因素是否有新规定？
答：《办法》第十七条前三款规定，本办法所称分支机构营业收入，是指分支机构销售商品、提供劳务、让渡资产使用权等日常经营活动实现的全部收入。其中，生产经营企业分支机构营业收入是指生产经营企业分支机构销售商品、提供劳务、让渡资产使用权等取得的全部收入。金融企业分支机构营业收入是指金融企业分支机构取得的利息、手续费、佣金等全部收入。保险企业分支机构营业收入是指保险企业分支机构取得的保费等全部收入。
本办法所称分支机构职工薪酬，是指分支机构为获得职工提供的服务而给予各种形式的报酬以及其他相关支出。
本办法所称分支机构资产总额，是指分支机构在经营活动中实际使用的应归属于该分支机构的资产合计额。
因此，自2013年开始，企业应按照上述对三项因素的新规定对分配比例进行计算。
4、汇总纳税企业当年的分配比例是按照什么时点的三项因素进行计算的？需要分段计算么？
答：《办法》第十七条第四款、第五款规定，本办法所称上年度分支机构的营业收入、职工薪酬和资产总额，是指分支机构上年度全年的营业收入、职工薪酬数据和上年度12月31日的资产总额数据，是依照国家统一会计制度的规定核算的数据。
一个纳税年度内，总机构首次计算分摊税款时采用的分支机构营业收入、职工薪酬和资产总额数据，与此后经过中国注册会计师审计确认的数据不一致的，不作调整。
因此，自2013年开始，汇总纳税企业当年度的分配比例不需要分段计算，均采用上年度全年的营业收入、职工薪酬数据和12月31日的资产总额数据。
5、新成立的分支机构，没有上年度的三因素数据，如何参与分配？
答：《办法》第五条第三款规定，新设立的二级分支机构，设立当年不就地分摊缴纳企业所得税。
因此，当年新设立的分支机构应于设立次年开始参与计算分配比例。
6、企业如果出现了分配比例计算有误，导致季度预缴的时候各分配机构分别存在多缴和少缴的情况，怎么处理？
答：《办法》第二十条规定，汇总纳税企业未按照规定准确计算分摊税款，造成总机构与分支机构之间同时存在一方（或几方）多缴另一方（或几方）少缴税款的，其总机构或分支机构分摊缴纳的企业所得税低于按本办法规定计算分摊的数额的，应在下一税款缴纳期内，由总机构将按本办法规定计算分摊的税款差额分摊到总机构或分支机构补缴；其总机构或分支机构就地缴纳的企业所得税高于按本办法规定计算分摊的数额的，应在下一税款缴纳期内，由总机构将按本办法规定计算分摊的税款差额从总机构或分支机构的分摊税款中扣减。
因此，存在因分配比例计算有误导致季度预缴税款不准确的，可按上述规定在下一税款缴纳期进行调整。
7、汇总纳税企业发生财产损失，需要税前扣除，是否有特殊规定？
答：《办法》第二十五条规定，汇总纳税企业发生的资产损失，应按以下规定申报扣除：
（一）总机构及二级分支机构发生的资产损失，除应按专项申报和清单申报的有关规定各自向所在地主管税务机关申报外，二级分支机构还应同时上报总机构；三级及以下分支机构发生的资产损失不需向所在地主管税务机关申报，应并入二级分支机构，由二级分支机构统一申报。
（二）总机构对各分支机构上报的资产损失，除税务机关另有规定外，应以清单申报的形式向所在地主管税务机关申报。
（三）总机构将分支机构所属资产捆绑打包转让所发生的资产损失，由总机构向所在地主管税务机关专项申报。
二级分支机构所在地主管税务机关应对二级分支机构申报扣除的资产损失强化后续管理。
因此，汇总纳税企业发生财产损失税前扣除时，总分机构均应按上述规定进行申报。
8、小型微利企业，税款很少，总分支机构分配缴税很麻烦，可不可以不分配？
答：《办法》第五条第二款规定，上年度认定为小型微利企业的，其二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税。
答：《办法》第五条第四款规定，当年撤销的二级分支机构，自办理注销税务登记之日所属企业所得税预缴期间起，不就地分摊缴纳企业所得税。
第十五条第三款规定，分支机构分摊比例按上述方法一经确定后，除出现本办法第五条第（四）项和第十六条第二、三款情形外，当年不作调整。
因此，当年有注销分支机构的情况，与旧政策规定不同，注销的分支机构应自办理注销税务登记之日起不就地分摊缴纳企业所得税，并且调整总分公司的分配比例，此分支机构也不再参与分配比例的计算。
10、新政策下发后，总分机构应该在什么时候备案分配表？
答：《办法》第九条第一款规定，汇总纳税企业预缴申报时，总机构除报送企业所得税预缴申报表和企业当期财务报表外，还应报送汇总纳税企业分支机构所得税分配表和各分支机构上一年度的年度财务报表（或年度财务状况和营业收支情况）；分支机构除报送企业所得税预缴申报表（只填列部分项目）外，还应报送经总机构所在地主管税务机关受理的汇总纳税企业分支机构所得税分配表。
因此，企业应在预缴申报同时报送汇总纳税企业分支机构所得税分配表，不需另行备案。
11、企业在季度申报时需要报送上一年度的财务报表，年报时也需要报送，这不是重复报送吗？
答：《办法》第九条第二款规定，在一个纳税年度内，各分支机构上一年度的年度财务报表（或年度财务状况和营业收支情况）原则上只需要报送一次。
因此，汇总纳税企业在首次执行《办法》时需要在季度申报时报送上一年度的财务报表，以后在年终汇算清缴时报送当年的财务报表即可。
答：《办法》第三十一条规定，汇总纳税企业不得核定征收企业所得税。
因此，分支机构应该按规定汇总纳税计算缴纳企业所得税，不得核定征收企业所得税，应按规定汇总纳税。
答：《办法》第三十三条规定，本办法自2013年1月1日起施行。
因此，汇总纳税企业2012年度企业所得税汇算清缴时仍适用国税发［2008］28号文件，不适用本《办法》。
14、企业业务招待费的扣除标准还是以销售额1500万作为界定，按照相关比例进行扣除吗？
答：《中华人民共和国企业所得税法实施条例》（中华人民共和国国务院令512号）第四十三规定，企业发生的与生产经营活动有关的业务招待费支出，按照发生额的60%扣除，但最高不得超过当年销售（营业）收入的5‰。
因此，您企业业务招待费的扣除按照上述文件规定执行。
15、企业的工资薪金支出是否包含企业应承担的养老保险费、住房公积金和职工福利费等？
答：《国家税务总局关于企业工资薪金及职工福利费扣除问题的通知》（国税函［2009］3号）第二条规定，《实施条例》第四十、四十一、四十二条所称的“工资薪金总额”，是指企业按照本通知第一条规定实际发放的工资薪金总和，不包括企业的职工福利费、职工教育经费、工会经费以及养老保险费、医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费等社会保险费和住房公积金。……
因此，您企业的工资薪金支出不包含企业应承担的养老保险费、住房公积金和职工福利费。
16、企业将账上一台不需用的机器设备对外出售，请问发生的损失如何税前扣除？
答：《国家税务总局关于发布〈企业资产损失所得税税前扣除管理办法〉的公告》（国家税务总局公告2011年第25号）第九条第（一）款规定，下列资产损失，应以清单申报的方式向税务机关申报扣除：（一）企业在正常经营管理活动中，按照公允价格销售、转让、变卖非货币资产的损失；
因此，您企业将账上一台不需用的机器设备对外出售，发生的损失需要以清单申报的方式向税务机关申报扣除。
17、企业这个月发生的电费如果没有取得凭证，下个季度预缴企业所得税时应该如何核算？
答：《国家税务总局关于企业所得税若干问题的公告》（国家税务总局公告2011年第34号）第六条规定，企业当年度实际发生的相关成本、费用，由于各种原因未能及时取得该成本、费用的有效凭证，企业在预缴季度所得税时，可暂按账面发生金额进行核算；但在汇算清缴时，应补充提供该成本、费用的有效凭证。
因此，您企业下个季度预缴企业所得税时可暂按账面发生金额进行核算，但在汇算清缴时，应补充提供该成本、费用的有效证明。
18、企业所得税季度预缴税款时，“利润总额”是否应扣除期间费用？与会计计算的“利润总额”一致么？
答：《国家税务总局关于发布＜中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表＞等报表的公告》（国家税务总局公告2011年第64号）规定，申报表第4行“利润总额”是填报按照企业会计制度、企业会计准则等国家会计规定核算的利润总额。
因此，企业在计算“利润总额”时应该扣除期间费用，与会计口径计算的“利润总额”一致。
19、我们是新成立的有限公司，从事各种管道清洁的业务，是不是有规定说2002年之后成立的企业都在国税交企业所得税？
答：《国家税务总局关于调整新增企业所得税征管范围问题的通知》（国税发［2008］120号）第一条规定，2009年起新增企业所得税纳税人，应缴纳增值税的企业，其企业所得税由国家税务局管理；应缴纳营业税的企业，其企业所得税由地方税务局管理。
因此，因为管道清洁不是增值税的征收范围，属于营业税征收范围，所以您企业应该在地税申报缴纳企业所得税。
20、我们是外商投资企业，以前享受了旧政策二免三减半的优惠政策。现在要注销，听说以前享受外资企业二免三减的政策需要补税？
答：《国家税务总局关于外商投资企业和外国企业原有若干税收优惠政策取消后有关事项处理的通知》（国税发［2008］23号）第三条规定，外商投资企业按照《中华人民共和国外商投资企业和外国企业所得税法》规定享受定期减免税优惠，2008年后，企业生产经营业务性质或经营期发生变化，导致其不符合《中华人民共和国外商投资企业和外国企业所得税法》规定条件的，仍应依据《中华人民共和国外商投资企业和外国企业所得税法》规定补缴其此前(包括在优惠过渡期内)已经享受的定期减免税税款。各主管税务机关在每年对这类企业进行汇算清缴时，应对其经营业务内容和经营期限等变化情况进行审核。
因此，如果企业注销时仍符合原政策规定享受优惠的各项条件，则不需要补税，如果企业注销时不符合原政策享受优惠的条件了（例如经营期不满10年注销了）则需要补税。
21、我们企业对外投资，在持有期间发生价值变动，根据会计制度按照公允价值进行账务处理，有损失，是否可以在所得税前扣除？
答：《中华人民共和国企业所得税法实施条例》（中华人民共和国国务院令第512号）第七十一条第二款规定，企业在转让或者处置投资资产时，投资资产的成本，准予扣除。
因此，企业在尚未处置该资产前按照会计制度确认的损失不得在企业所得税前扣除。
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