1、分子量小，易于吸收
氨基酸序列分析证明NK是由275个氨基酸组成的单链多肽相对分子量为27728，远远小于UK（分子量为5～6万）等其它生物活性酶，因此在作为药用成分方面具有易被人体吸收的优点。
2、酶活高，溶栓效率高
NK无论体内或体外实验，都证明其纤溶活性为其它生物活性酶的2～4倍以上。NK不仅自身具有降解血浆中交联纤维蛋白的作用，而且还可以促进组织内t-PA的合成，因而具有双重作用，所以溶栓效率高。
3、速效，起效时间短
在NK服用者的血中观察优球蛋白溶解时间（ELT）、优球蛋白的纤溶活性（EFA）以及纤维蛋白降解产物（FOP）的变化发现，EFA提高，且在口服后第4d达到最高，并可维持到第8d；同时FOP在口服后第一天即迅速达到最高值。可见NK不仅作用迅速，而且维持时间长。
4、半衰期长，药物作用时间长
目前临床上应用的以生物活性酶为有效成份的溶栓药物其体内作用时间多为20～30分钟，半衰期相当短。以UK为例，UK的体内半衰期仅为8分钟，故上述药物只能作为注射药物，而NK体内半衰期为8小时，且体内作用时间可维持到8天。
5、溶栓机理明确，具有明确靶向作用
纳豆激酶由275个氨基酸组成，呈单链结构，无二硫键、作为丝氨酸蛋白酶，其活性中心为Asp32、His64、Ser221，它可以有效的分解血栓的主要成分－－纤维蛋白及其他H－D－Val－Leu－Lgs－Pna等合成的基质，表现出血浆纤维蛋白溶酶相似的特异性。因而NK溶栓机理明确，具有明确靶向作用。
6、纳豆激酶可制成口服药物，方便服用
NK等电点为PI=8.6±0.3，且具有抗胰酶水解能力。实验证明NK可经人体小肠吸收进入血液，因而可制成口服方便服用。
7、纳豆激酶无内出血倾向，可长期服用，服用安全
大多数溶栓药物如UK、SK、t-PA等都是纤溶酶原激活剂，均通过激活纤溶酶原转变为纤溶酶来发挥溶栓作用。而降解纤溶酶原可导致全身性内出血，为此上述药物的使用患者均应住院且在医师的监督下严格控制剂量应用。而NK在发挥纤溶作用时，并不激活纤溶酶原，它直接作用于交联纤维蛋白，对交联纤维蛋白有很强的水解活性，但对纤维蛋白酶原却并不敏感。实验证明，NK的纤维蛋白酶原水解活性远低于纤溶酶和弹性蛋白酶，甚至尿激酶，而与t-PA基本相同，因此NK在发挥纤溶作用的同时，不易引起出血倾向，可长期服用，服用安全。
8、纳豆激酶来源于食品，安全性能好
NK最早发现于日本的纳豆食品，人类有几千年的应用历史。NK参照《西药新药研指南》（1994）检验，该受试物在本实验条件下，测得小鼠静脉注射的LD50为1500±200mg/㎏。因而NK属无毒级，安全性能好。
综上：纳豆激酶在体内可溶解血栓，明显地降低血液粘稠度、纤维蛋白原含量、红细胞压积值、以及激活体内的血管内皮细胞产生t-PA，NK在发挥纤溶作用的同时，不水解血浆纤维蛋白原，不引起内出血，是理想的第二代治疗与预防血栓类疾病的产品，同时产品具有价格低、酶活稳定、半衰期长、无毒副作用、原料易得等优点。
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