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多项测序技术让生命科学各个领域发生翻天覆地变化

最近,各项测序技术可谓火爆发展,尤其是单细胞领域,多项技术全面展开,为了方便大家,大程特异总结出来各项技术要点,以飨读者:

1.改进型ATAC技术直接探查脑组织DNA活性区域

NGS领域大牛Howard Y Chang近期在Nature Methods提出了更新版的ATAC protocol,相比较于以前的技术更大的提高了信噪比,而且使用新的去垢剂配方,从而更多的去除线粒体的信号。

从而可以直接从冻的样品直接进行ATAC试验。

2.高通量型酵母双杂交

酵母双杂交是探查蛋白质相互作用的神器,如果两个蛋白可以发生相互作用,可以促进报告基因的表达,然而这项技术需要针对于诱饵蛋白一个一个进行探查。

为了大规模的探究,科学家们分别表达两组大规模的蛋白,然后利用酵母双杂交,当两个蛋白能够发生相互作用,则可以促进cre酶的表达。

从而cre的活性可以将表达两个蛋白的质粒发生重组。

进而产偶联的片段,从而进行PCR富集。发现相应的相互作用偶联对。

3.直接定量单细胞水平的蛋白水平和转录组水平

虽然目前可以有效的进行单细胞的RNA-seq,然而真正发挥作用的是蛋白质,因此对于准确的探究蛋白质表达水平的差异,急需在单分子水平解决。

为了解决这个问题:

科学家们使用抗体进行免疫杂交,而抗体上偶联不同的DNA分子,在杂交结束后,裂解细胞,这些DNA分子也会被测序出来,因此通过测序则可以知道这些蛋白的表达水平差异。

基于这项技术科学家们对免疫细胞进行广泛的探究。

4.全面探查RNA调节染色质的相互作用

著名华人科学家Fu Xiang-Dong在Nature Biotech发表文章,开发新型测序方法,全面揭示了RNA染色质相互作用。

主要的原理是当RNA与染色质靠近时候,利用一个linker将RNA分子和RNA结合的DNA分子直接连接起来,然后利用测序,则可以发现特定的DNA与RNA的相互作用。

科学家们发现多组特异的相互作用,这项技术极有可能改变表观遗传的研究进程。

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