中医防治疾病的主要工具是中药，中药品种的稳定与可靠，是中医临床用药安全、有效的基本前提。如果中药品种不可靠，质量就可能不稳定，中药质量欠稳定，即便医师处方合理，也很难保证治疗疗效，所以中药的品种问题是影响中药疗效的瓶颈之一，应予重视。
一药多品种，影响中药疗效
中药品种不同，化学成分必然不同，其药理活性和临床功用亦应有差别。如石斛一药，《中华人民共和国药典》（2010年版）（以下简称《中国药典》）记载，石斛为铁皮石斛、金钗石斛、鼓槌石斛或流苏石斛的栽培品及其同属植物近似种的新鲜或干燥茎。
传统中医认为，石斛的品种不同，功用存在差异。如张寿颐说：“金钗石斛则躯干较伟，色泽鲜明，能清虚热，而养育肺胃阴液者，以此为佳……若肺胃火灼，津液已耗，舌质深赤干燥，或焦黑嗜饮者……必以皮色深绿，质地坚实，生嚼之脂膏黏牙，味厚微甘者为上品，名铁皮石斛。”可见，金钗石斛养阴作用优，铁皮石斛清热效果良。而宋代寇宗奭《本草衍义·第七卷》则指出，金钗石斛不堪入药，其谓：“今人多以木斛浑行，医工亦不能辨。世又谓之金钗石斛，盖后人取象而言之，然甚不经。”寇氏认为，金钗石斛因“名称”贵重而受到重视，其入药实是“不经”之举。
关于石斛不同品种的质量研究，现今认为，铁皮石斛最优，环草石斛其次，黄草石斛、金钗石斛、马鞭石斛质差。所以虽然同是《中国药典》品种，其质量也有差异。尚有文献指出，黄草石斛有小毒。由此可知，如果当今药房供应的是铁皮石斛，医生处方疗效就有一定把握，如果供应的是金钗石斛、黄草石斛等，其疗效就欠稳定了。
中药的一药多品种情况甚多，其中不乏常用中药，如威灵仙、麻黄、黄芪、甘草、升麻、刘寄奴等。认真研究不同品种之间的药性差别，分别管理，分别使用，这是保证中医用药有效的重要前提。如果能够做到“一味药一个品种”，对于稳定中药饮片质量是有益的，更是中医标准化建设的一个重要课题。
一地一品种，影响中药疗效
《中国药典》虽然规定了收载的每一味中药来源植物的种属，但各地中药师在工作实际中，往往根据自己的经验，采购惯用品种，而这些惯用品种则未必是《中国药典》品种，从而造成品种的混乱，影响疗效。
如土茯苓一药，《中国药典》规定为百合科光叶菝葜的干燥根茎。而云南、四川一些地区，将百合科的无刺菝葜的干燥根茎（俗称红萆薢）作土茯苓入药，当地同时又将土茯苓（光叶菝葜）反过来作萆薢入药。如此混乱品种，怎能保证中医用药效果呢？
所以同样的药名，在不同地区给付不同药物，医生处方纵是合理，也未必都能如愿取效。
败酱草正品为败酱科植物黄花败酱和白花败酱的带根全草，性味苦寒，功能清热解毒、消痈排脓，主治肠痈等。而我国北方习惯用菊科植物苣荬菜带根全草作败酱草入药，习称“北败酱草”，《本草纲目·第二十七卷》谓其“苦，寒，无毒”“夏三月宜食苦荬，能益心和血通气也”“凡病痔者，宜用苦苣菜……日洗数次，屡用有效”。南方则习惯用十字花科植物菥蓂带果全草作败酱草入药，习称“南败酱草”。《本草纲目·第二十七卷》谓其“甘，平，无毒，和中益气，利肝明目”。可见败酱草代用品的品种不同，药性迥别，南者甘平而北者苦寒，南者益气而北者和血，二者皆与正品有异。故目前中医欲用败酱草解毒排脓以治疗肠痈，则是有药名而无药实，欲取其效，何等之难。同时南方医者报道用败酱草治愈何病，在北方是重复不出疗效的，反之亦然，因为所用药物非一个品种。
同科近功。是说同一科植物，因为植物体内成分相似，故其功用也相近。而败酱草、升麻等药，在不同地区使用的完全是两个不同科的植物，故其效应也需要予以关注。
全国各地使用的中药品种不甚统一，同一张处方，在此地调剂有效，在彼地调剂就可能无效或效果差。所以一地一品种问题必须解决，其关键是采购药品的药师要按《中国药典》标准（药典未收载者以省、市、自治区标准）把关，切忌凭个人经验进药，因为经验未必规范、科学。
古今异品种，药性各不同，影响用药疗效
当我们阅读古代医书、方书、本草书时，不禁为其记载的高效、速效验案所惊讶。但现今临床遇到类似情况时，比照使用，则效果并非如原书所云那样“神奇”，原因何在？不能排除古代文献有夸大疗效的可能，但也可能存在品种问题。如果我们重复不出古人的疗效时，就可能怀疑古人，甚至怀疑中医，更有甚者则否定中医，这不是科学的态度。
古今品种混乱大约有两方面原因，一是我们不明确古人所用的品种。如百合科植物贝母是临床常用药，品种甚繁，有浙贝母、川贝母、暗紫贝母、甘肃贝母、伊贝母、湖北贝母等，古代中医有善用本地药材的习惯，因其采收方便，这样某一古人使用的贝母，疗效虽确切，但很难知道其品种。今人临床使用贝母，若幸好与古人使用贝母品种相符，就可以取得类似古人的疗效，反之就难以再现古人疗效。
二是我们即使能够明确古人的用药品种，但今人却以另种代之。《金匮要略·妇人妊娠病脉证并治第二十》中的葵子茯苓散是治疗妊娠小便不利的名方，该方由茯苓和冬葵子组成。冬葵子为锦葵科植物冬葵的种子，而现在大多数地区以锦葵科植物苘麻的种子作冬葵子使用。冬葵子有利小便、主“五癃”的作用，而苘麻子则是止痢、明目之品，二药药性差别极大，完全不是一种药物，根本不可能用出医圣张仲景所言的疗效。
我们临床医生，若自主经营医药，应固定使用一个品种的中药，以避免品种不统一，影响中药疗效。若只是诊病处方，则嘱咐患者在固定医院或药店购药，尽量不要变换购药地点，因为相当一部分中药是一药多品种的，而一个药店的药师，受个人鉴别中药经验的影响，通常习惯使用某一品种，而另一个药店的药师，可能习惯使用另一品种。稳定中药品种是保证中药疗效的一个重要环节。
中药的品种混乱影响中医用药疗效是客观现实，从源头抓起，规范中药种源，是中药现代化的必须途径，也是保证和提高中医用药疗效的关键之一。澄清中药品种混乱问题是一项长期复杂的任务，首先要从技术层面制订标准，然后从法规、行政方面制订管理措施，而后强制性实施。否则不规范中药的品种，品种不稳定、质量不可靠，临床遇到疑难病症，即便是扁鹊再世也无可奈何。
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