这款开源软件，曾被Nature评为十大影响科学的计算机代码项目！

ImageJ

下载地址：

https://imagej.nih.gov/ij/download.html

细胞计数

ImageJ能够很方便地记录图片上的粒子个数，如细胞、病斑、孢子等等，下面以人体红细胞图片为例，介绍一下它的计数方法。

首先打开图片，点击菜单【Image】→【Type】→【8bit】，将图片转化成8位的灰度图。

然后调整图片对比度，点击菜单【Image】→【Ajust】→【Brightness/Contrast】，将图片调整到合适的对比度，这里用了Auto来自动调整。

由于计数时只需要黑白两种颜色，需要点击菜单【Image】→【Ajust】→【Threthold】，用阈值算法将颜色合并来调整，这里也是用Auto来自动调整。

得到上述图片后，先要确定图片中粒子大小，可以点击菜单【Analyze】→【Measure Panicles】，将粒子大小设置为1进行预计算，得到平均粒子大小186.7，然后以这个数值作为粒子大小重新计数，就能得到比较准确的粒子数目了。

条带灰度分析

ImageJ还有另外一个重要的功能：条带灰度值分析（DNA或Western Blot条带），下面是它的具体操作~

首先，打开条带图片，点击菜单【Image】→【Type】→【8bit】，同样是将图片转化成8位的灰度图。

然后，点击矩形工具选择要分析的条带，点击菜单【Analyze】→【Gels】→【Select First Lane】，选中后矩形框内会出现1的符号。

点击菜单【Analyze】→【Gels】→【Plot Lanes】，就可以得到初始峰图。

接着，用工具栏中的直线工具将峰图下方封口，使其成为几个独立的区域；用魔棒工具分别点击这几个独立的区域，得到最后的灰度值统计结果。

最后，在excel中整理数据，并在Prism中画出相应的柱状图。

今天我们仅仅列举了ImageJ的两种功能，它还有很多强大的功能等你来探索哦~