西方科学是在精密仪器的基础上发展起来的，其巨大的成功使科学家们认为，精密仪器能够帮助我们认识自然界的一切，而哲学这个过去认识自然更锐利的武器降落为无足轻重的陪衬。可问题是，精密仪器真的能够帮助我们认识真实的自然界吗？
从原子说假设成为科学的基础开始，科学家们就一直认为，只要把那几个基本粒子还原出来了，终极的自然规律就找到了。可结果呢？分解到一定程度，物质消失了，变成了同一种东西——能量，用它也可以造出所有基本粒子，可能量是什么？它无形无象、无所不在，科学家们迷惑了。
对生物的认识也是一样，科学家们一直就认为，我们只要还原出生物最基本的结构，生命的秘密就显现出来了。可结果呢？科学家们还原出了基因，DNA，却发现生命的秘密离我们还有很远，因为再分解下去，就是和非生物的组成一样了，它们都是由死的原子组成的。
认识自然有两条途径，一种是哲学的思辨，一种是科学的观察，哲学可以为科学提出原理，指明科学发展的方向，科学则可以验证这些原理，并为新原理的提出提供新的依据，两者是相辅相成、缺一不可的。而西方科学呢？则迷信于精密仪器，而抛弃了哲学，没有了哲学的指导，自然会出现这种情况。
很多人不了解哲学，其实，哲学之所以有价值，就是因为自然内在的统一性，它告诉我们，人和万物一样，不仅由同一种物质组成，也由同一个原理支配，所以，人存在与发展的原理就是万物存在与发展的原理，认识了自己，也就认识了自然，哲学就是一门通过认识自我来认识自然的学问。
显然，哲学方法本质上就是系统方法，它根据万物在运动原理上的统一性，通过系统间的类比来认识万物。有了这种方法论，我们就可以从宏观系统来认识微观系统，从可观察的系统现象来认识不可观察的系统现象，进而得到对自然更本质的认识。
从哲学角度来分析，精密仪器的局限显而易见。首先，万物归一，组成精密仪器的物质应该和所有被观测的物质本质上是一样的，用它只能观测由统一物质组织起来并出现个性的东西，而对共性的统一性的混沌状态是永远不可观察的，因为此时，两者是不可分的。如果我们迷信精密仪器，就忽视了隐藏在精密仪器背后的物质世界。
其次，组成精密仪器的原子并不是死的，而是和生物一样，是标准的物质系统，它的存在不是天赋的，而是和周围世界的变化一一对应，或者说是同步的。用它来观察世界，就如同站在火车上看火车上的东西是静止的一样，其实，一切物体都是在不对称变化中存在的，而精密仪器中观察到的世界则是静止的，对称的。
那么真实的世界应该是怎么样的呢？让我们从哲学的角度来分析一下：
第一，从哲学角度，物质是彻底统一的，精密仪器只能观察到它的有序状态，而对它的混沌状态永远不可观察。比如，质能转换现象，表面上是物质消失变成了能量，其实是物质从可观察的有序状态向不可观察的无序状态转化释放了能量，物质在这里是不灭的。
第二，从哲学角度，物质的基础并不是死寂不变的，而是充满着紧张和生命力。形象地说，统一的物质在空间中不仅是连续的，而且是在紧张地相互压迫中存在的，因此，只要是物质性的存在，它一定是在被压迫中存在，本身就充满着能量，是物质和能量的统一体，其能量大小就体现在物质彼此之间的紧张程度之上。
第三，从哲学角度，一切物质系统的存在都不是天赋的，而是在反抗周围空间中的混沌物质不对称运动中存在的。精密仪器忽视了这些混沌物质和它的不对称运动，造成了对系统秩序的不可理解。
第四，从哲学角度，万物皆是活的，而且是在变化中存在的，组成精密仪器的原子也是活的，因此，它观察到的东西就不是客观的。比如，地球上的引力变化，根据平方反比定律，太阳对地球的引力，月亮对地球的引力都是周期变化的，可精密仪器却一点也测不出来。
不可否认，西方科学依赖精密仪器取得了巨大的成功，但同时也把西方科学推向了死胡同。因为没有了哲学的指导，科学的发展就是畸形的。要取得科学的进展，就必须将哲学与科学有机地统一起来。
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