一个工程项目如果有两个和两个以上的施工企业承担施工时，根据国家对建设工程管理的要求，建设单位和施工企业要实行承包责任制和总分包协作制。
在这种情况下，要求一个施工企业作为总包单位向建设单位（发包单位）总承包，对建设单位负责，再由总包单位将专业工程分包给专业性施工企业施工，分包单位对总包单位负责。

一、分包工程会计科目设置

1、预付账款－预付分包单位款

2、应付账款－应付分包单位款

二、分包工程会计核算程序

1、预付料款、工程款；

2、分包单位开具结算账单时对其完成工程量的处理

3、结算工程款的处理

1、向分包单位预付料款

借：预付账款－预付分包单位款

贷：银行存款

2、按照工程分包合同，预付分包单位工程进度款

借：预付账款－预付分包单位款

贷：银行存款

3、月终根据与分包单位确认的“工程价款结算账单”确认应付的工程款

借：工程施工—合同成本—分包工程费用

贷：应付账款－应付分包单位款

4、扣除已预付的工程款和预付料款，支付剩余的未付分包工程款

借：应付账款－应付分包单位款

贷：银行存款

预付账款－预付分包单位款

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