在休渔期结束后，渔船与商船交汇局面增加，商船应保持高度戒备，并应根据渔船成群结队朝一个方向航行的特点，及早制定避让方案，并充分注意到渔船不愿让商船穿插其间的情况，尽可能避免从渔船船队中间穿越，避免发生碰撞事故。
在设计航线时，也应充分考虑安全避让渔船。在设计航线前，应熟悉各个渔区的情况，了解所航经渔区及其周围环境、海上气象、潮汐潮流清况。如可行，航线应尽可能避开渔区，适当远离岸边航行，以避开或减少与渔船相遇，尽量避免驶入渔船密集的地方。如在所经水域有分道通航制，应当尽可能使用分道通航制；如没有分道通航制，应当尽可能使用海上的习惯主航路。海上的习惯主航路，一是离岸边距离适当，二是渔民了解，一般情况下极少有渔船在习惯主航路水域从事捕鱼，所以按习惯主航路航行，极大地减少了与作业捕鱼船相遇的机会。
此外，商船要尽可能了解渔船捕鱼的方式，掌握渔船捕鱼的交通流总流向，提前制定相应的避让方案。如从渔船渔具伸出方向通过，应注意避开渔船渔具，避免渔船为保护渔具而采取一些过急措施而与商船发生碰撞。在渔船密集区域，应当通过雷达观察等手段，找出渔船相对稀少的水域，谨慎操纵船舶从该水域通过，避免船舶进入渔船密集区域而发生危险。
在休渔期结束后的最初一段时间内，应注意到会有渔船为争抢渔汛多捕鱼，违反航行、避碰规定的情况发生，商船在渔区航行时，应及时收听海事管理机构、交管中心（VTS）、海岸电台等播发安全提醒信息，了解渔船动态，及时避让渔船。
对渔船不遵守《1972年海上避碰规则》和其他航行规定的情况要有充分的思想准备，加强瞭望，以安全航速行驶，对渔船尽可能采取早让、宽让。由于渔船船员对《1972年海上避碰规则》理解不甚全面、为争抢渔汛多捕鱼等各方面的原因，渔船往往不遵守有关的航行、避碰规定，尤其是在休渔期结束后20天内更是如此，因此，商船船员对此应当有充分的思想准备。在瞭望方面：应当加强瞭望、及时开启雷达，必要时加派瞭头和请船长上驾驶台亲自指挥操纵船舶；在安全航速方面：应当保证在任何时候均以适合当时环境和情况的安全航速行驶，在接近渔船密集区时，应提前通知机舱备车、减速航行；在避让方面：应当严格遵守避碰规则“早、大、宽、清”的要求等。
同时，渔船也要了解水道、航路分布，尽可能避开商船习惯航路和交通流密集水域作业；遵守相关海上避碰规则，加强值班，特别是夜班的航行、作业值班，加强了望，主动做好与商船的沟通联系；尽可能编队出海作业，严禁“带病”出海；严禁超抗风等级、超航区、超载、载客，禁止“抢船头”航行；日常工作生活中，各位船员应注意安全意识，责任意识，法律意识和自身业务能力的提高。
在避让从事捕鱼的船舶、让清渔船的同时，还应让清渔船所使用的渔具。在避让中，还应注意如下事项：
■ 在雾中应加强雷达瞭望，即使雷达上没有发现渔船，也应按章鸣放雾号。
■ 一旦误入渔网或穿过渔网时，应立即停车淌航，以免渔网缠入螺旋桨。
■ 对于未从事捕鱼作业的机动渔船，尽管不属于“从事捕鱼作业的船舶”，也不享有直航的权利，但应注意此渔船上的驾驶员并不一定有清楚的认识，必要时应主动避让。
■ 渔船在使用国际信号简语时，单字母旗的意义如下：
G 表示“我正在收网”。
Z 表示“我正在放网”。
P 表示“我的网已紧紧地挂在障碍物上”。
T 表示“我正在从事成对底拖捕鱼作业，避开我”，或者用一长声表示。
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