ImageJ之对免疫组化图片定量评价和自动评分

首先这款神器的插件在哪里可以下载？

IHC Profiler插件可以在https://sourceforge.net/projects/ihcprofiler/免费获取。

其次这款插件如何安装到自己的Imagj软件中？

1、解压下载好的IHC_Profiler.zip文件，得到两个文件：IHC Profiler文件和IHC_Profiler.txt宏文件。

2、复制这两个文件粘贴至Plugins文件夹中：

My Computer > C: > Program Files > ImageJ > plugins

此外复制IHC_Profiler.txt文件粘贴至macros文件夹中：

My Computer > C: > Program Files > ImageJ > macros

重启软件即可，我们会在Imagej软件Plugins中发现已经安装好的IHC_Profiler插件。

如何使用该插件?

对于胞浆着色的IHC图片，读入图片能够快速得到结果。

对于胞核着色的IHC图片：

计算Score的公式为：

Score有四个等级，分别为4/3/2/1，High Positve为4分，Positive为3分，Low Positive为2分，negative 为1分。

整个分析的流程如下：

现在我们以实际例子来演示整个操作：

1、打开Imagej软件，软件界面如下：

File，Open，打开胞浆着色的图片：

2、点击Plugins，点击IHC Profiler，进入以下界面：

询问是否是胞浆着色，下拉可选择核着色，此处选择胞浆着色，点击OK，进入以下界面，选择H DAB点击OK。

得到结果为High Positive：

 而对于胞核着色，操作略微不同：

1、 打开Imagej软件，打开胞核着色图片：

2、点击Plugins，点击IHC Profiler，进入以下界面，选择胞核着色：

同上选择H DAB，点击OK

进入以下界面：

调节Threshold阈值选中所有核着色，点击Plugins，选择IHC Profiler Macro，得到结果：

这个用于临床或者科研组织病理学分析的新工具可以在全球范围内用于评估大多数定位于细胞质或者细胞核的蛋白质，这种方法可以尽量减少不同实验室之间观察者之间差异的问题，为进一步为跨国间的临床试验提供了有效的保证。

参考文献：

IHC Profiler: An Open Source Plugin for the Quantitative Evaluation and Automated Scoring of Immunohistochemistry Images of Human Tissue Samples，PLoS One. 2014;e96801. pii:PONE-D-13-52755. doi:10.1371/journal.pone.0096801.

拓展视频学习：如何运用Imagej提取颜色