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Nature子刊:“跳跃基因”助长癌症

“跳跃基因”(jumping genes)又被称为转座因子,它是一种可以改变其在基因组中位置的DNA序列。跳跃基因可能会产生突变,亦或是逆转突变,细胞的遗传特性和基因组大小会因此而改变。而DNA如果发生变异则可能会促进癌症的发展。


难以确定的“跳跃基因”

在漫长的人类进化过程中,“跳跃基因”被随机整合到人体的基因组中,据不完全统计哺乳动物体内一般却含有几十万数量的跳跃基因DNA。由于跳跃基因并不等同于突变,它们不能被传统的癌症基因组测序所识别,所以人们很难判断“跳跃基因”的存在,或者是出现的时间和地点。

近日,圣路易斯华盛顿大学医学院的一项新研究,在很大程度上暗示了一种在肿瘤生长过程中被称为“跳跃基因”的遗传现象。这项研究发表在的Nature Genetics杂志上。


跳跃基因的进化历史是目前许多研究的主题,普遍认为病毒感染在它们的起源中扮演着重要的角色。因此,这项研究为未来可能针对此类基因的癌症疗法开辟了新的研究方向。


所有肿瘤中都能找到“跳跃基因”

由桑福德大学的Ting Wang和Karen P. Loewentheil等杰出医学教授领导的研究人员探索了基因组数据库,专门寻找那些 “跳跃基因”推动癌症生长的肿瘤。


跳跃基因为肺癌细胞系中的致癌基因提供了真正的启动子 图片来源:10.1038/s41588-019-0373-3

Ting Wang和他的同事们发现,许多癌症都会过度增长并促进肿瘤生长,在这些癌症中“跳跃基因”就像是一种隐形的开关,这些神秘的开关可以迫使基因一直处于开启状态,即使它应该关闭。

研究人员表示:“如果你进行典型的基因组测序,寻找导致癌症的基因突变,你不会发现跳跃基因。与其他癌症类型相比,跳跃基因在某些癌症类型中更为重要,但平均而言我们发现,所有的肿瘤都至少有一种跳跃基因能激活癌症基因。”

这是很重要的信息,因为这些肿瘤往往具有侵略性,所以如果医生能提前知道这一点,他们可能会采取更积极地治疗策略。这也为未来的癌症治疗提供了新的研究目标。

Ting Wang和他的同事研究了癌症基因组图谱(TCGA)项目的一部分,他们收集了涉及15种癌症类型的7769个肿瘤样本。研究人员发现,在3864个肿瘤(包括乳腺癌、前列腺癌、肺癌、结肠癌、皮肤癌和脑癌)中,共有129个跳跃基因充当着106个癌症基因的隐形开关。

虽然“跳跃基因”存在于各种癌症中,但它们的重要性因肿瘤类型的不同而大不相同。例如,12%的胶质瘤(一种脑癌)中至少有一个“跳跃基因”被激活。相比之下,87%的肺鳞状细胞癌都包含“跳跃基因”。


迈出跳跃基因研究的第一步


Ting Wang(右),研究生Hyo Sik Jang(中)和Nakul M. Shah 图片来源:Matt Miller /华盛顿大学医学院

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