命门为生命之根

肾两者，坎外之偶也；命门一者，坎中之奇也。一以统两，两以包一，是命门总主乎两肾，而两肾皆属于命门，故命门者，水火之府，阴阳之宅，为精室之宅。命门居两肾之间，即人身之太极，以生两仪，而水火具焉，消长系焉，故为受生之初，为性命之本。”（同上）在这里，宇宙生成观，植入医学理论中，认为命门即人身的太极，太极动而生阳，静而生阴，阴阳荡摩，而生成万物；在人身，命门则作为人之所以获得生命的基础，所谓人之初生，生由脐带，脐接丹田，是为气海，即命门也。所谓命门者，先天之生我者，由此而受；后天之成我者，由此而栽也。命门者，为水火之府，为阴阳之宅，为精血之海，为死生之窦。在人的生命过程中，命门也发挥着重要的作用。景岳说：“命门者，诸精神之所系，元气之所舍，男子以藏精，女子以系胞。五脏之阴气非此不能滋，五脏之元气非此不能发。而脾胃以中州之土，非火不能生，然必春气始于下，则三阳从地起，而后万物得以化生，岂非命门之元气在下，正为脾胃之母乎？吾故曰：脾胃为灌注之，得后天之气也；命门为化生之源，得先天之气也，此其中故有本末之先后。”（同上）这是说人在出生之后，生长发育，虽然依赖于脾胃功能的正常发挥，而脾胃功能之所以能正常发挥，却依赖于命门之元气在下，而为“脾胃之母”的缘故。

进一步说，人身五脏六腑，十二经脉的正常，都与命门密切相关。“命门之火，谓之元气；命门之水，谓之元精。此命门之水火，即十二脏之化源。

故心赖之，则君主以明；肺赖之，则治节以行；脾胃赖之，济仓原之富；肝胆赖之，资谋虑之本；膀胱赖之，则三焦气化；大小肠赖之，则传导自分。总而言之，人的一身，所有藏精、系胞、主生育、为十二经之根本，乃至于五脏六腑的原动力，都是命门的作用。正是因为如此，“若命门亏损，则五脏六腑皆失所侍，而阴阳病变无所不至也。其为故也，正以天地发生之道，始终在下；万物盛衰之理，盈虚在根。在下之根本断绝，人的生命也就结束了。