1950年8月，第一届全国卫生工作会议召开。卫生部副部长贺诚和王斌邀请南京政府时期《废止中医案》主要人物、70岁的余云岫参会，并支持他废止中医的观点。
1951年以“中医是封建医”精神起草颁布《中医师暂行条例》在全国施行。
1.围剿：90%中医师被取消资格
毛泽东极为重视中医药，确定了“面向工农兵”“预防为主”“团结中西医”新中国卫生工作三大方针。
他为第一届全国卫生工作会议题词：
团结新老中西各部分医药卫生工作人员，组成巩固的统一战线，为开展伟大的人民卫生工作而奋斗。
1950年毛泽东为第一届全国卫生工作会议题词
然而，卫生部副部长贺诚、王斌二人坚定地反中医，认为中医是封建医，应随封建社会的消灭而消灭，其主持的第一届全国卫生会议及之后颁布的《中医师暂行条例》《中医师暂行条例实施细则》，在行政和法令层面形成了对中医的围剿。
左为贺诚，右为王斌
《条例》和《细则》对中医师规定苛刻，如：
①在公立、私立中医院校学习4年以上，持有毕业证书者，经大行政区卫生部审核合格，由中央人民政府卫生部颁发中医师证书；
②通过中央政府卫生部组织的中医师考试合格者，可申领中医师证书；
③《中医师暂行条例》颁布前，已通过省级人民政府卫生部门组织的考试并通过者，也可申领中医师证书；
④中医师资格考试内容有笔试、口试及实际操作两部分，其中笔试部分包括必试科如生理解剖学概要、细菌学概要、本草概要、古方概要、传染病概要等，选试科包括内科（包括妇科、儿科）、外科、眼科、针灸科、正骨科、按摩科等。
1951年颁布《中医师暂行条例》
这对中医师形成了重大制约，一是考试内容完全超出了传统中医所要掌握的基本医学知识；二是中医师培养以师承为主，建国初期全国并无多少中医院校。
北京90%以上的中医师考试不及格；
山西省运城专区18 个县无1名合格中医；
天津市中医水平是比较高的，但参加考试的530 多名中医仅55人个合格；
江西省卫生厅1950 年、1951 年进行2次全省中医师登记审查换发执照工作，总登记人数8728 人，而承认为正式中医师的仅424 人、不及5%，审为临时中医师的3648 人，其余取消了资格。
在这一政策下，到1953 年，全国92 个大中城市和165 个县，合格中医师只剩1.4万人，绝大多数中医师被取缔。
1951年9月7日，毛泽东对卫生部党组书记、副部长贺诚关于全国防疫工作报告作出批示
同时，具体卫生工作中也存在歧视中医现象：
吃中药不报销；
大医院不吸收中医参加工作；
办中医进修学校主要讲授简单的西医诊疗技术，鼓励中医改学西医；
各高等医学院校不讲授中医药课程；
中华医学会不吸收中医会员；
对中药产供销无人管理，盲目取缔一些深受群众欢迎又确能治病的中成药。
自此，中医药业一片萧条。
2.换将：毛泽东撤掉两名副部长
1953年6月，国务院文教委员会副主任钱俊瑞将卫生部消灭中医的做法上报中央，引起毛泽东高度重视。
毛泽东认为，中医药是人民群众赖以防疾治病的主要力量，看不起中医药是一种极端卑鄙的资产阶级思想的反映。
1953年一次中央政治局会议上，毛泽东撤销了贺诚、王斌的副部长职务。
让“神父”管“和尚”，只能是越管“和尚”越少。
他把中医提到对全世界有贡献的高度。
严厉评当时卫生行政部门某些人排斥中医、歧视中医的错误倾向时指出：“祖国医学遗产若干年来不仅未被发扬，反而受到轻视和排斥，对中央关于团结中西医的指示未贯彻，中西医的真正团结也未解决。这个问题一定要解决，错误一定要纠正，首先就要各级卫生行政部门思想上要改变。”
他认为，如果中西医对立和歧视长期存在下去，不仅我国保健事业将受到重大损失，更是我国文化遗产一种损失。
上世纪50年代福建省人民医院中医诊室场景
针对中医药发展状况，1953 年12 月，毛泽东发表《对卫生工作的指示》，指出：
我认为中国对世界上的大贡献，中医是其中的一项。
中医是在农业、手工业的基础上发展起来的。西医是在近代工业基础上发展起来的。
中医宝贵的经验必须加以继承和发扬。对其不合理部分要去掉。
西医也有不正确的地方，也有机械唯物论。将来发展只有一个医，应该是唯物辩证法作指导的一个医”。
1954 年6 月，毛泽东再次对中医学文化问题发表重要谈话，他说，中西医比较起来，中医有几千年历史，而西医传入中国不过几十年；直到今天，全国人民疾病的诊疗依靠中医的仍占绝大多数，依靠西医的则仅占少数，而且多半在大城市里。中医对我国人民的贡献是很大的。
中国有六万万人口，是世界上人口最多的国家。我国人口所以能够生衍繁殖，日益兴盛，当然有许多原因，但医药卫生事业所起的作用，必是其中重要原因之一。
历史证明，中医对我国人民有很大的贡献。
毛泽东与中国中医研究院首任院长鲁之俊亲切握手
他还对中西医结合提出具体的建议和要求，如他针对当时实际情况提出：
①要抽调100- 200 名医科大学或医学院校毕业生交给有名的中医，去学他们的临床经验，而且学习就应当抱着虚心的态度……西医学习中医是光荣的，因为经过学习与提高，就可以把中西医界限取消，成为中国统一的医学，以贡献于世界。
②各医院要有计划地请中医来院看病和会诊，允许住院病人用中药。
③中药应当很好的保护与发展，我国中药有几千年的历史，是祖国极宝贵的财富，如果任其衰落下去，那是我们的罪过。
④中医书籍应进行整理。过去由于难懂再加上不重视，无人整理，中医医书如不整理，就将绝版。应组织有学问的中医，有计划有重点地先将某些有用的，从古文译成现代文，时机成熟并应组织他们自己的经验编出一套系统的中医医书来。
1956年，毛泽东接见四大名中医之一的施今墨（左一）
毛泽东创造性地提出中国统一的新医学文化思想，提出实现中西医学相结合从而取消中西医学界限，并指出中西医学结合，首先是西医学习中医，而不是中医学习西医。
1956年，《中医师暂行条例》《中医师暂行条例实施细则》以及有关解释、说明等文告一律废止。
3.调兵：任命首任中医司司长
1956年，党中央为加强卫生部的中医工作，决定成立中医司。
当时，谭震林向毛泽东主席介绍推荐说：“吕炳奎是个名中医，应该让他出来管中医工作”。
毛主席立即调吕炳奎任中央卫生部中医司司长。
吕炳奎
吕炳奎年少时师承嘉定名中医汪志仁，19岁挂牌行医，后投笔从戎，先后任江南抗日义勇军第三支队队长、浙东军政分委书记、华中海防纵队政委、华中海上工委书记、江苏省委统战部副部长等职务。
1954年任江苏省卫生厅长兼党组书记，组建了全国第一所中医院、中医进修学校，编写各种教材27种，两年多培养200多名各科师资，有力支持了全国中医学院建设，仅向北京中医学院就输送40余名教师。
吕炳奎深感中医司责任重大，他表态：“要为中医讲话，为中医事业工作。”
在毛泽东关心下，经卫生部中医司努力，中医药事业迎来了春天。
1958年1月5日，毛泽东在杭州小营巷视察爱国卫生工作
到 1957 年 3 月，全国有 20 万中医参加了联合中医医院、联合诊所、农业合作社的保健站等单位的疫病防治工作，有29000 余位中医参加了各公立医疗机构工作，20 余万中医在党的中医政策的感召下组织了起来。
1960年初，全国中医学院的师资队伍已基本形成，为新中国中医教育奠定了基础。
全球疟疾肆虐时，1967年5月23日，中国启动对抗疟疾的中药研制。
39岁的屠呦呦临危受命，成为课题攻关的组长。
屠呦呦（前右）与老师研究中药
她从中国古代药典《肘后备急方》这一宝库中发掘出青蒿素，经过反复试验，1971年提炼出的青蒿素对疟疾抑制率达到100%。
2011年9月，屠呦呦因此获得拉斯克医学奖。
2015年10月，荣获诺贝尔生理学或医学奖。
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