波黑原本是南斯拉夫的一个加盟共和国。南斯拉夫原本在铁托执政时期很稳定的。可惜铁托死了以后，南共走错了路，搞了不该搞的西方民主式道路，加之西方国家的挑拨和渗透，导致南斯拉夫国内的民族矛盾在铁托死后迅速激化。南共在苏东剧变浪潮中丢失了对全国的统治权，随之民族分裂主义在南斯拉夫愈演愈烈，先是斯洛文尼亚，接着是克罗地亚，再接着是马其顿，先后宣布独立。
波黑内战从1992年爆发，至1995年在美国的军事干预下结束，一共打了三年。这期间大部分时间内，都是穆族和克族结成联盟，对抗塞族，虽然中途也发生过穆族和克族的军事摩擦。三族都有自己的后台，其中塞族的后台是南联盟（南斯拉夫解体后、塞尔维亚、黑山又组成了南斯拉夫联盟共和国），还有俄罗斯，克族的后台是独立出去的克罗地亚，而穆族的后台则是沙特以及中东国家的圣战分子。
与其说这是一场战争，不如说这是一场种族大屠杀。在内战前，波黑三族都是彼此杂居的，上班时是同事，下班时是邻居，甚至通婚的都不在少数。可是在民族主义分子的煽动下，同事间邻居间都成为了仇敌，彼此操起东西互杀，甚至老公杀老婆、老婆杀老公的都比比皆是（可见人性有多阴暗！）而穆、克、塞三族的武装则比起历史上的纳粹武装有过之而无不及，他们基本上占领一块地方，把不属于本民族的人要么通通赶走，要么全部杀掉，当然妇女不杀，全部抓起来关进监狱里充当军妓。
在这样残酷的武装冲突下，波黑大批难民外逃其他国家，外逃的人总计上百万，这给欧洲国家带来了巨大的压力。本来西方国家是巴不得波黑人杀波黑人杀来杀去的，事实上战争也是西方国家挑起来的，可是一但战争危及到了自己的利益，这些西方国家立马不干了。
于是西方国家打着联合国的名义，在安理会推出了一个又一个决议案，先是对波黑和南联盟进行武器禁运，再接着是对南联盟进行经济制裁，想压南联盟调解解决冲突。然而都不管用。接着西方国家的政客又抛出一个又一个的和平方案，然而请神容易送神难，波黑三族间一但开杀，就都杀红了眼，连西方主子的账也不买了。
最后没办法了，美国只好使出了自己的杀手锏，那就是直接军事干预。1995年，美国打着北约的旗号，出动战斗机、轰炸机并发射巡航导弹，重击了波黑塞族的指挥通迅系统，把塞族武装打成了聋子哑巴，接下来穆克联军趁机反扑，夺占了塞族占领的大片土地。塞族在失去军事优势的情况下，被迫接受了美国强加的《代顿协议》，波黑仍然作为一个联邦，分为穆克联邦和塞尔维亚共和国两个单位，波黑的首脑则由穆克塞三族的人轮流当任，一个人只当几个月，联合国维和部队进驻波黑维持和平。
波黑内战一共死亡了20多万人，这死亡的20多万人中大部分都不是战死的武装人员，而是被种族清洗的无辜平民。一系列惨无人道的暴行被揭露后，震惊了全世界，引起了世界公愤。于是在联合国的推动下，安理会通过了决议，成立前南斯拉夫战犯法庭。
然而这样一个法庭与其说是为受害者主持公道，不如说是拉偏架，他几乎只追究塞族人的罪行，对同样严重的穆族和克族的暴行却不管不问，上法庭的几乎全是塞族人。后来这个法庭更是沦为了政治工具，打着追求公正的旗号，把不愿意屈服西方国家的南联盟前领导人米洛舍维奇给送上了审判庭。
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