肿瘤细胞和微环境的异质性
及其对三阴性乳腺癌的临床意义
江科,董梦婷,李春阳,盛佳钰
上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院
目的:三阴性乳腺癌是一种侵袭性乳腺癌亚型,具有广泛的瘤内异质性。我们的目的是系统地描述三阴性乳腺癌的肿瘤异质性。
方法:从5例三阴性乳腺癌患者中获得205个三阴性乳腺癌细胞的单细胞RNA测序数据。过滤后,使用Seurat包进行细胞聚类分析。根据细胞周期标记基因,对每个细胞簇进行评分。并对每个细胞簇的标记基因进行功能富集分析,接着进行配体-受体信号网络分析。使用CIBERSORT根据58例正常邻近组织和101例三阴性乳腺癌组织的RNA测序数据估计每个样本中22个免疫细胞的比例。最后,评估免疫细胞的预后价值。
结果:一共聚集了B细胞、髓细胞、基质细胞、T细胞和肿瘤细胞等5种细胞类型。根据PC1和PC2,年轻的三阴性乳腺癌细胞与老的三阴性乳腺癌细胞有明显的区别。功能富集分析揭示了各细胞基因的功能异质性。基于配体-受体对进行细胞间通信网络。在三阴性乳腺癌组织中发现22个免疫细胞部分存在异质性。此外,这些免疫细胞在相邻的正常组织和三阴性乳腺癌组织中存在显著差异。其中,巨噬细胞M2和中性粒细胞与三阴性乳腺癌的临床结局显著相关。此外,三阴性乳腺癌的临床特征与T细胞CD4记忆静止、单核细胞、中性粒细胞、巨噬细胞M1和CD4记忆激活的T细胞的比例显著相关。PCA结果显示,这些免疫细胞可以将三阴性乳腺癌组织与相邻正常组织进行明显的区分。
结论:我们的发现表明了三阴性乳腺癌的肿瘤异质性,这加深了对肿瘤细胞与其微环境,尤其是免疫细胞之间复杂相互作用的理解。
关键词:三阴性乳腺癌;单细胞RNA测序;免疫细胞;异质性;肿瘤微环境
通信作者:江科(surgeonjk@163.com)
引用格式:江科, 董梦婷, 李春阳, 等. 肿瘤细胞和微环境的异质性及其对三阴性乳腺癌的临床意义. 第十六届全国乳腺癌会议暨第十五届上海国际乳腺癌论坛论文汇编. 2020:E001.
收稿日期:2020-04-18
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