数据资源 | Cell：人肠内分泌细胞mRNA和分泌组图谱

近日，来自荷兰的研究人员在《Cell》发表了其最新研究成果：通过分析人体肠内分泌细胞（ECC），得到了人EEC-TAG生物库和ECC mRNA及分泌组图谱，为深入了解人EEC的发育和功能提供了宝贵资源。

ECC可以感知肠道内容物并释放激素，以调节全身的许多过程。研究团队开发了一个基于类器官的平台，用于研究人ECC，并生成mRNA和分泌组图谱。

ECC是什么？

肠道的主要功能是消化食物和吸收营养，但作为最大的激素产生器官，它也需要通过肠内分泌细胞（EEC）分泌激素。ECC是一种罕见的分泌细胞，占上皮细胞的1%以下，其感知肠内物质并释放激素以调节肠胃活动，全身代谢和食物摄入。同时，越来越多的研究表明ECC是代谢性疾病（即肥胖和糖尿病）的治疗靶点。

由于EEC的稀有性和缺乏生理相关的体外模型，对人类EEC的研究具有挑战性。几乎没有人类EEC永生化的细胞系，当前也没有人类EEC亚型图谱。尽管已在小鼠中描述了一些激素分泌的诱导剂，但尚无实验模型可系统地评估此类促分泌剂对人EEC的作用。因此，研究团队开发了一个基于类器官的平台，提供人类EEC的详细分子和功能描述。

主要研究结果

研究团队通过瞬时表达NEUROG3在体外诱导EEC形成，设计了一套肠道类器官，其中的主要激素被荧光标记，构建了带有激素荧光报告原件的生物库EEC-TAG。

利用类器官库进行单细胞RNA测序，利用2255个细胞（其中805个细胞经过BMP处理）构建了人EEC单细胞转录组图谱。

比较了人EEC与鼠类EEC的主要区别（包括激素，感觉受体和转录因子）。

通过液质联用（LC-MS）对EEC的分泌产物深入分析，再次证实近端（例如GAST，GHRL，MLN和CCK）和远端（例如PYY，NTS和GCG）肠类器官的特定激素加工和分泌。同时，研究人员还发现了一些新的EEC分泌产物，包括NPW，MIDKINE，VGF，和肽酶CPB1。

研究数据

这项研究的所有批量和单细胞RNA测序数据均已保存在Gene Expression Omnibus（GEO），数据编号GSE146799。

原始MS数据存储在PRIDE中，数据编号PXD017468。

参考文献

Beumer J, Puschhof J, Bauzá-Martinez J, et al. High-Resolution mRNA and Secretome Atlas of Human Enteroendocrine Cells[J]. Cell, 2020.

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