大家好，今天给大家介绍的一篇文章题目为“Multi-Omics Analysis of the Prognosis and Biological Function for TRPV Channel Family in Clear Cell Renal Cell Carcinoma（肾透明细胞癌TRPV通道家族预后及生物学功能的多组分分析）受体电位香草样蛋白(TRPV)通道家族TRPV1-6已被证实对各种癌症的广泛病理过程有深刻影响。然而，透明细胞肾细胞癌(ccrCC)的生物学功能和预后价值仍然大部分未知的文章。
01
研究背景
瞬时受体电位香草素（TRPV）通道家族TRPV1-6已被确定可深刻影响各种癌症的广泛病理过程。然而，TRPV在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的生物学功能和预后价值仍然在很大程度上是未知的。
我们从癌症基因组图谱（TCGA）数据库中获得了539例ccRCC患者的基因表达数据和临床信息。一系列数据库用于数据处理和可视化，包括GEPIA，GeneMANIA，MethSurv，GSCA，TIMER和starBase数据库。
见图一
分析示意图。
图一
见图二
TRPV家族在人正常组织和肿瘤组织中的分布。
图二
（A）GTEx数据集中TRPV成员的表达谱的热图。
（B）TRPV1，（C）TRPV2，（D）TRPV3，（E）TRPV4，（F）TRPV5（G）TRPV6在正常组织（黑色）和肿瘤（红色 ）中各种器官的中位表达。 基于GEPIA数据库构建的条形图。
见图三
TRPV家族在ccRCC组织中的mRNA表达。
图三
（A）TRPV1-6在不同癌症类型的表达水平。
（B）2对ccRCC和邻近正常组织中TRPV3/5/6/72表达的分析*P<0.05;P **<0.01;P<0.001;ns，没有意义。
（C）GSE2数据集中TRPV3/5/6/53757表达式的热图。
（D）基于GSE2数据集分析ccRCC和邻近正常组织中TRPV3 / 5 / 6 / 53757表达。*P<0.05;P<0.001。
见图四
TRPV家族成员的基因组改变和TRPV家族基因的基因-基因和蛋白质-蛋白质相互作用网络。
图四
（A）cBioPortal数据库概述了ccRCC患者中TRPV家族成员的基因组改变。
（B）通过GeneMANIA数据库分析的与TRPV家族相关的基因网络。
（C）TRPV家族基因编码的蛋白质之间相互作用的网络图。
（D）TRPV家庭成员之间的相关性分析。*P<0.05;**P<0.01。
见图五
TRPV家族在ccRCC中的生存分析。
图五
（A）ccRCC中TRPV1-6的单变量Cox回归分析。
（B）ccRCC中TRPV1-6的多元Cox回归分析。
（C）Kaplan-Meier生存曲线比较了CCRCC患者中TRPV3的高表达和低表达，包括总生存期，疾病特异性生存期和无进展间期生存期。
（D）Kaplan-Meier生存曲线比较了ccRCC患者中TRPV4的高表达和低表达，包括总生存期，疾病特异性生存期和无进展间期生存期。
见图六
TRPV家族在ccRCC中的预后和诊断价值。
图六
（A）列线图模型集成了TRPV3 / 4表达和TNM阶段，用于预测ccRCC的1年，3年和5年总生存期的概率。
（B）列线图模型的校准曲线。
C）TRPV家族成员的ROC分析。TRPV2/5/6在ccRCC和正常组织之间显示出有希望的辨别能力。
见图七
TRPV3 mRNA表达与临床参数的关联。
图七
（A）trpv3在ccRCC组织和正常对照中表达的代表性图像。原始放大倍率 50× 和 100×。
（B）TRPV1-6表达与ccRCC患者病理分期的相关性。基于（C）病理分期的trpv3在ccRCC中的mRNA表达;（四）T期;（五）N期;（六）M阶段;（G） 组织学分期;（H） 性别;（一）血清钙;（J） 操作系统事件。*P<0.05;**P<0.01;P<0.001。
见图八
TRPV3在ccRCC中的DNA甲基化分析。
图八
（A）ccRCC中TRPV3 mRNA表达与DNA甲基化水平之间的相关性。
（B）ccRCC组织中TRPV3的启动子甲基化水平。
基于（C）淋巴结转移状态的ccRCC中TRPV3启动子甲基化水平;（四）肿瘤分级;（五）个体癌症分期。**P<0.01;P<0.001。
（F）从MethSurv数据库获得的ccRCC中TRPV3的DNA甲基化热图。
（G）不同CpG位点的ccRCC中TRPV3的DNA甲基化的预后价值。
见图九
ccRCC中TRPV3相关基因集的功能富集分析。
图九
（A）火山图中显示了CCRCC中TRPV3高表达与TRPV3低表达的差异表达基因（DEGs），橙色点代表高表达TRPV3的ccRCC中显著上调的基因，蓝点代表显著下调的基因。
（B） 热图显示表达式级别。
（C）上调基因KEGG通路的富集分析。
（D）上调基因GO项的富集分析。
（E）下调基因KEGG通路的富集分析。
（F）下调基因GO项的富集分析。
见图十
CCRCC中TRPV3的免疫细胞浸润分析。
图十
（A）ccRCC样本中22种肿瘤浸润免疫细胞（TIIC）的比例。
（B）高和低TRPV22表达组之间3个TIIC水平的差异。
（C）森林图显示了24个免疫细胞丰度与TRPV3 mRNA表达之间的关系。TRPV3的转录水平与ccRCC组织中Treg细胞浸润水平呈显著正相关。
（D）根据高低TRPV3表达对ccRCC患者Treg细胞浸润的存活分析。
见图十一
ccRCC中TRPV3表达与免疫检查点之间的相关性。
图十一
（A）评估ccRCC中ACE2和免疫检查点分子关系的雷达图。
（B）TRPV3的共表达热图和CTLA4，PDCD1，TIGIT和LAG3的表达。
（C）散点图显示，TRPV3 mRNA表达与CTLA4、PDCD1、TIGIT和LAG3的表达呈显著正相关。
（D）与低表达组相比，TRPV4高表达组CTLA1、PDCD3、TIGIT和LAG3的表达显著上调。P<0.001。
见图十二
鉴定miR-10b-5p作为ccRCC中TRPV3的潜在上游miRNA。
图十二
（A）StarBase数据库分析的miRNA-TRPV3调控网络。
（B）TRPV3与候选miRNA之间的相关性。
（C）miR-10b-5p在ccRCC中被下调。P<0.001。
（D）ccRCC患者在miR-10b-5p高表达的情况下生存率较高。鉴定SNHG3和AL513497.1作为ccRCC中miR-10b-5p的潜在上游lncRNA。
（E）森林图显示了24个免疫细胞丰度与miR-10b-5p表达之间的关系。miR-10b-5p的表达与ccRCC组织中Treg细胞浸润水平呈显著负相关。
（F）与低表达组相比，miR-10b-5p高表达组的Treg细胞水平显着下调。P<0.001。
（G）散点图显示，miR-10b-5p表达与CTLA4、PDCD1、TIGIT和LAG3的表达呈显著负相关。
见图十三
鉴定SNHG3和AL513497.1作为ccRCC中miR-10b-5p的潜在上游lncRNA。ccRCC中潜在lncRNA的相关性分析。
图十三
（A）共表达热图显示，潜在的lncRNA与TRPV3呈正相关。
（B）SNHG3和AL513497.1与miR-10b-5p呈负相关，与TRPV3呈正相关。
（C）SNHG3和AL513497.1在ccRCC中上调。P<0.001。
（D）SNHG3和AL513497.1的高表达预测ccRCC患者的生存率更差。
（E）SNHG3/AL513497.1-miR-10b-5p-TRPV3轴在ccRCC致癌作用中的模型。
02
研究结论
综上所述，trpv2/3表达在ccRCC肿瘤组织中上调，而TRPV5/6表达下调。TRPV2/5/6是ccRCC患者的潜在诊断生物标志物，TRPV3/4是潜在的预后生物标志物。
此外，ccRCC中TRPV3表达异常可能是由DNA甲基化失调引起的。此外，TRPV3与Treg细胞浸润和免疫检查点表达具有显著的正相关关系。激活或阻断TRPV3相关信号通路可能为ccRCC患者的免疫治疗提供新的见解
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