以人与自然的关系以及整体与局部的关系来说，它都是根据人体系统与地球系统之间的类比得到了。大家都知道潮汐效应，对应于自然变化，万物都有潮汐效应，但只有水的潮汐效应最强，这就说明，水对自然变化的能量吸收能力最强。人体的水占70%，地球表面上的水也占70%，而且其化学成分类似，都含有大量无机盐。既然大自然变化主要通过作用于地球上的水来影响地球，那么它必然也主要是通过作用于人体的水来影响人体的新陈代谢。再者，地球表面的能量循环主要靠什么？当然是水循环，对应于人体，人体能量循环的主要方式必然也是水循环。既然水是人体能量运行的载体，当然经络就是人体组织液循环的通道。由于人体的水主要集中在经络当中，因此，大自然变化也主要是通过经络系统来作用于人体的。
中医非常强调人体的平衡，可大家知道为什么平衡对人体非常重要吗？原因就在于人体的管理需要平衡。人体的能量（信息）主要是依赖自由氢质子在水分子链上的快速递进，通过包络在无机离子周围的有序水层的周期组织与离散来传递的，信息的区别仅仅在量上，或者说频率上的不同，而在质上没有任何两样，如果组织液在人体出现了不平衡，信息就会在传递的过程中失真和变形，这样一来，整体的管理就乱了，而疾病就是整体管理失控的一种结果。
事实上，中医学中本身就包含着一个完整的系统科学体系，它就体现在气理学说当中。气即气一元论，它用统一的一种物质（气）的有序（阴）和无序（阳）变换的规律来解释自然界的一切。而这个理就是阴阳学说，这其实是一个标准的系统理论，因为物质从无序向有序转化就是物质系统的产生，从有序向无序转化就是物质系统的灭亡，阴阳学说本质上就揭示了物质系统产生、发展、壮大、衰退、灭亡的规律性。由于自然界的一切物质都是成系统的，因此，阴阳学说就是对大自然最普遍规律的一种揭示。
显然，我们只要在中国以一元论的基础上对西方的系统科学进行重建，一个完整的系统科学体系就会建立，有了这个方法论，我们就可以通过系统间的类比来认识那些精密仪器观察不到的物质运动，从而更深刻地认识自然的本质。当然，只要认识到了人与自然的关系，以及整体与局部的关系，就可以从科学高度来认识中医了！
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