晚清以来，随着中国传统文化日渐被质疑乃至否定，以及西方医学的强势进入和迅猛发展，一代代中医学人为了自身的生存，努力用现代的科学和学科思维，力图使中医走向现代化。可结果呢？却是中医理论和实践分了家，医和药分了家，中医不仅没有得到有效的证明，而且使中医的灵魂更远离我们而去。
目前，中医的最大问题就是理论的现代化，因为唯有现代化，才能够使更多的人了解中医。国民了解了中医，才会优先选择中医，中医才有市场；学子们了解了中医，才能够学好中医，中医疗效才能够提高。象过去那样，学子们学不好中医，疗效强差人意，国民治病根本不找中医，你中医水平再高也没有用。
实践是检验真理的唯一标准，中医经过了历史上时间最长，人数最多的实践检验，是当之无愧的科学，至少是潜科学。可为什么西方科学却解释不了它呢？要认识这一点，我们就必须从科学的前提假设入手来说。
熟悉科学的人都知道，科学都是建立在假设之上的，西方科学也是如此，每当出现一个全新的科学假设，物理学就发生一次革命。出现了牛顿的绝对时空观，就创造了牛顿三大定律和万有引力定律；出现了以太观，就统一了光电磁，完善了电磁学方程；出现了光速不变和相对性原理，就产生了相对论和量子力学。如果没有全新的科学假设，物理学只能停留在原地踏步。
其实，不管有多少种假设，无非是对两点的说明，一个是实体的构成，一个是空间的构成，这两者牵涉到对自然的本质认识。比如，如果空间真的是空无一物的，那么光就只可能是子弹一样的粒子运动；如果空间中连续着物质，那么光就只可能是媒介波。牛顿的绝对时空观认为空间是空无一物的和对称的，以太观认为空间中连续着一种特殊的物质，而光速不变则否定了空间中连续的物质，把空间重新回到了空间的空无一物和对称。如果这种发展趋势走下去的话，那么下一步必然就是重新承认空间中连续着物质。
很多人不明白，空间中有没有连续物质的存在和中医有什么关系？其实关系大了，如果空间中有连续物质，那么人和自然就有关系，如果空间中没有连续物质，那么人就是孤立在自然之中。从中医的特点我们就知道，中医始终认为，人是自然无限小的一部分，顺应自然则生，违背自然则死，疾病就是大自然对不顺应它的人的一种惩罚。因此，建立一个空间中连续着物质的时空观势在必行。
事实上，中医学中确实有一个与西方科学完全不同的前提假设，它就是气一元论，按照这个学说，空间中连续着统一的物质，它们并不是静止不动的，而是在紧张地相互压迫中存在的，反抗周围物质的压迫是一切存在物的本性，也正是这种本性的存在，局部物质才不断在反抗周围物质的压迫中组织起来，成为一个个暂态的有序结构，我们观察到的一切都是由统一物质组织起来的不同花样，而看起来空无一物的空间则是统一物质的无序状态。
表面上来看，这似乎有点象以太观，其实它和以太有着根本性的不同。我们比较一下就知道了，在对实体的认识上，以太观认同原子说假设，即万物是由少数几种死寂不变的基本粒子组成的，而气一元论则认为万物都是由同一种生命之流（气）汇聚而成的；在对空间的认识上，以太观认为空间中静止不动地连续着一种特殊的物质（和实体有本质的不同），而气一元论则认为空间中连续着统一的物质（和实体本质上一样，只是一个聚一个散而已）；在对实体和空间关系的认识上，以太观认为两者没有任何关系，而气一元论则认为实体是统一物质的有序状态，空间是统一物质的无序状态，两者是在不断地相互转化中存在的。当年以太观被否定，恐怕就是这种“四不象”的观点所造成的。
如果把气一元论作为科学的前提假设，那么一个全新的科学体系就建立起来了。
对空间的认识，空间中连续着不对称运动的统一物质；
对实体的认识，万物都是在反抗物质的不对称运动中组织起来的暂态有序结构。
对共性和个性的认识，物质是统一的，只有一种共性，之所以会出现不同的个性，则是因为物质组织起来所表现出来的一种性质，最初产生环境的不同使它们具有了不同的个性。在微观，和混沌物质在质上没有任何两样。
物质层次的认识，这里的物质指的是物质系统，它们的存在都和一种普遍联系方式有关，因为系统是一个典型的一控制多的过程，没有这种普遍联系方式，系统就不可能形成，所以，一种普遍联系方式对应着一个物质层次，也对应着一种自然力。
对吸引和排斥的认识，物质是统一的，自然力只有一种最普遍的力，那就是物质之间紧张地相互挤压。它所以会出现吸引和排斥现象，则是因为物质本质是有生命力的，可以不断组织起来，吸引现象就是由物质的组织引起的，它会造成相空间的压缩，使连续在周围的混沌物质向这里不对称流动，引力就是这种不对称运动的表象；反过来，排斥力是由物质离散引起的，它会造成相空间的膨胀，使连续在空间中的混沌物质向周围扩张，排斥力同样是这种不对称运动的表象。
对物质形态的认识，统一的物质有两种存在形式，一种是有序状态（阴），一种是无序状态（阳）。
对物质运动方式的认识，统一的物质有两种运动方式，一种是线性的，即相对不变的实体连续在空间中移动，如子弹；一种是非线性的，即依赖连续在系统空间某一层次的物质有序和无序周期变换传递能量。
那么这个科学体系是什么呢？从气一元论就可以推导出来。按照气一元论，气聚则生，气散则亡，气聚散的规律就是它所揭示的大自然最普遍规律；按照阴阳学说，阴是统一物质的有序状态，阳是统一物质的无序状态，由阳向阴转化就是物质系统的产生，由阴向阳的转化就是物质系统的灭亡。显然，从气一元论就只能推导出一个科学体系，那就是系统科学。
西方科学为什么认识不了中医？其实只在于两点，一个是对人与自然关系的认识，一个是对整体与局部关系的认识。西方科学基于观察不到就不存在的理由否定了它，才造成了中医和西医之间的矛盾。而中医呢？恰恰就是建立对这两种关系的把握之上的，认识到了人与自然的关系，就得出了疾病的外因是人与自然的矛盾激化；认识到了整体与局部的关系，就得出了疾病的内因是不平衡引起的整体管理失控。对病因的认识不同，当然治疗方法也完全不一样了，西医治病靠的是外力，用外力杀死病变细胞就是西医的全部，而中医治病靠的是整体的力量，因为按照整体决定局部的大自然规律，只要恢复了整体的管理，病变细胞就会在整体力量的控制下改邪归正。中医就是一门恢复人体管理的学问。
而研究人与自然关系，以及整体与局部关系的科学体系叫什么？当然系统科学！显然，我们只要在气一元论基础上建立一个完整的系统科学体系，中医就上升到科学高度了！那时，全世界都会承认中医的科学性，中医的发展就有望了！
有人可能会问，西方科学体系中也有系统科学，为什么它解释不了中医呢？答案其实很简单，这个系统科学是在还原论基础上拼凑的，或者说是建立在原子说假设之上的，不承认物质在空间中的连续性，生命问题不可认识，不承认物质彻底的统一性，普遍联系不可认识，这都是西方系统科学的死穴。唯有在气一元论假设之上重建西方的系统科学，才能够形成一个完整的系统科学体系，用它才能够真正地证明中医的科学性。
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