人体只有一个，关于人的科学也只有一个，因此，不管是中医还是西医，最终都要汇通如一，成为统一的医学体系。可中西医结合的实践已经有很多年头了，人们却发现它们是两个完全不同的医学体系，根本无法有效地结合，这到底是为什么呢？
“公说公有理，婆说婆有理。”之所以会出现这种情况，只是因为公和婆看待问题的立足点不同。要想使他们在认识上统一，前提就是统一立足点，否则两者永远是格格不入的。中医和西医的矛盾也在于此，它们分别是由不同前提假设之上的科学体系发展出来的。如果无法统一立足点，中西医永远无法有效结合。
很多人总以为中国古代没有科学体系，确实，科学这个名词本义就是分科之学，如果拿这个定义来套，中国古代确实没有科学体系。不过，如果把科学视为研究自然最普遍规律的学问，那么中国古代就存在一个完整的科学体系，因为中国的古人用统一的一种物质（气）的有序（阴）和无序（阳）变换的规律解释了自然界的一切。
自然界的物质不仅是统一的，而且是多样的。如何来科学地解释它，一直是思想家们所要解决的问题。在古希腊，一直存在两种完全对立的学说，一个是一元说，最典型的就是赫拉克利特，他认为自然界的一切都是由生命之火的燃起与熄灭造成的，这和中国的气一元论类似，把自然界的一切归于同一种物质（气）的聚散。另一种是原子说，它把自然界的一切都归于少数几种基本粒子的不同组合，西方科学就是在这个假设之上发展起来的。
显然，你用几种基本粒子的不同组合来解释世界是科学！那我们用统一的一种物质的聚散来解释世界难道就不是科学？现在的问题是，统一物质（气）的聚（有序）散（无序）到底是一种什么样的科学呢？其实，对系统科学有所了解的人都知道，它其实就是系统科学，因为物质（气）从无序（阳）向有序（阴）转化就是物质系统的产生，从有序（阴）向无序（阳）转化就是物质系统的灭亡，阴阳学说本质上描述了物质系统产生、发展、壮大、衰退、灭亡的规律性。
科学之所以能够称之为科学，就是因为自然呈系统的秩序，科学的目的就是为了探索支配自然秩序的规则，用来指导人的生存。可西方科学发展以来，我们除了对物质基本结构的认识取得了巨大的进展，但对自然秩序形成的规则却从始至终一无所知。更可笑的是，科学家们为了摆脱自然规律对人的束缚，开始否定必然性规律的存在，把自然界的一切建立在偶然之上。理性的人都知道，无限个偶然产生自然秩序的概率是零！或者说，不相信必然性规律的存在，自然秩序永远解释不了。最典型的例子就是科学家们发现机械力学对解释自然秩序无能为力之后，也发展出了系统理论，可这个系统理论却是建立在原子说假设之上，不相信自然内在的必然性，如此一来，不论科学家们用多大的力，都无法合理地解释自然秩序的存在。
西方科学去发展系统论，是不得已而为之，因为从原子说推导不出系统论。而东方科学则不然。东方科学的前提假设是气一元论，根据这个学说，万物都是由同一种物质组织起来的，最初产生环境的不同使它们具有不同的个性，普遍联系方式的不同使物质在自然界出现了层次。显然，万物归一，自然规律一定不是具体的东西，而只可能是物质的组织原理，或者说系统的发展规律。中医学就是建立在系统科学之上的。
过去我们搞中西医结合，基本上都是用西医去改造中医。本来中医是建立在系统之学之上的，它注重的是人与自然的关系，以及整体与局部的关系，而西医是建立在分科之学之上的，它注重的是人体的基本构件。这是两种完全不同的认识人体的方法，当然无从结合。
要想实现中西医结合，方法只有一个，那就是在气一元论假设之上对西方科学进行重建，从而形成一个完整的系统科学体系，唯有如此，才能够真正地认识西医精密仪器观察不到的关系，从而理解中医的科学性。比如，中医的病因学就是建立在对人与自然关系以及整体与局部关系的正确把握之上的，西医之所以与中医矛盾重重，就是因为精密仪器观察不到这两种关系。如果通过系统科学的方法论认识到了这两种关系，中西医之间的矛盾就化解了。
事实上，随着科学的发展，西方科学前提假设上的错误也逐渐显现出来，而在一个错误前提假设之上建立的科学大厦就象建立在沙堆上，肯定最终要崩溃的。西医的问题在哪？它最大的问题就是对病因认识上的错误，它造成了治疗方法的错误。与西医相比，中医对病因的认识更科学，诊断方法和治疗方法也更合理，西医唯有在中医的基础上进行重建，才能够实现真正的中西医汇通。
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