第三节：自然规律到底是什么？
有什么样的前提假设，就有什么样与之对应的科学理论。站在原子说假设之上，自然规律仿佛就存在于少数几个基本粒子的个性之上，只要挖掘出了它们，自然规律就找到了，西方科学一直是沿着这条还原论道路向前狂奔的。而按照气一元论假设，万物分解到最后都是同一种叫不出名字的东西，它告诉不了我们任何答案，真正的自然规律不是具体的某种东西，而是一个无形无象、无所不在的原理，或者说是一种必然性关系的揭示。要正确地认识它，方法只有一个，那就是哲学的思辨。也正是这个原因，中国的先人一直沉迷于哲学思辨当中。
由于还原论方法的巨大成功，科学家们开始迷信精密仪器，认为它能够帮助人类认识自然界的一切，而过去认识自然的主力军——哲学这种手段被当成是“仅仅是可能的猜测”抛弃到一边。没有了哲学的指导，精密仪器观察不到的物质运动被忽视，造成了科学不断走向了神秘主义和不可知论，不可自拨。
事实上，哲学并不是毫无理由的猜测，而是有着最坚实的物质基础，它就是物质的统一性。有了它的指导，我们就能够清楚地认识到，人和万物一样，不仅由同一种物质组成，也由同一个原理支配，因此，人存在与发展的原理就是万物存在与发展的原理，认识了自己，也就认识了自然。哲学就是通过认识自我存在与发展的规律来认识万物存在与发展规律的一门学问。
西方科学站在原子说假设之上，虽然也强调了物质的统一，但这种统一仅仅是一种泛统一，即统一到少数几个基本粒子之上。而哲学上的物质统一则是一种彻底的统一，即自然界的一切都是由同一种物质组成的，只有更小，没有最小，气一元论就揭示了这一点。也正是这种前提假设上的巨大差异，才造成了东西方两种不同的科学体系。
今天，还原论方法已经彻底暴露出它的局限性，这不仅仅是用它无法还原出更小的基本粒子，而且让科学陷入了无穷复杂细节当中，而忽视了对最普遍规律的追寻。当然，西方科学也在不断地反省自己，系统科学的出现就是对还原论方法的一种修正，但在原子说假设之一，这种修正是无力的，因为没有物质在空间中的连续和统一假设，系统科学就是一个空架子，用它解决不了任何实际的问题。
与西方科学不同，东方科学站在气一元论基础之上，很早就得出了万物归一气，万物同一理，这个理就是统一物质聚散的原理，阴阳学说就是对这个原理的一种揭示。很多人总是把阴阳学说看成是空洞的哲学概念，甚至是与科学格格不入的东西。但在事实上，阴阳学说有着坚实的物质基础，它就是气一元论，站在这个基础之上，阴就是气之有序状态，阳就是气之无序状态，由于连续在空间中的统一物质（气）是在不断地有序（阴）和无序（阳）变换中存在的，因此，阴阳学说就是对大自然最普遍规律的一种揭示。
对系统论有所了解的人都知道，物质从无序到有序的转化就是物质系统的产生，从有序向无序的转化就是物质系统的灭亡，阴阳变换本质上就是物质系统产生、发展、壮大、衰退、灭亡的规律的一种揭示。显然，东方也是有科学的，它就是系统科学，现代人认识不了，主要原因就在于对气一元论这个前提假设的不理解，而阴阳学说一旦离开了气一元论，就被抽去了骨架，成了不科学的东西。
现代人总是毫不怀疑地把西方科学称之为“科学”，但在事实上，科学之所以能够称之为科学，就是因为自然内在的秩序性，不管我们把目光投向宇宙的何方，从遥远辽阔的星系，到原子的极幽深处，我们都能看到规律性以及精妙的组织。我们所看到的物质和能量的分布并不是混乱无序的，相反，它们是按照从简单到复杂的有序结构安排的，从原子和分子，到晶体、生物，到行星系、星团等等，莫不是井井有条，按步就班。而且，物质系统的行为也不是偶然的、随机的，而是有章法的、成系统的，科学家的工作就是要揭示这个支配系统秩序的必然性规则，用来指导人的生存。可西方科学发展到现在，对这个支配自然秩序的规则不仅一无所知，而且还在不断否定自然内在的必然性，而没有了必然性，科学的灵魂就丢了，一个不能够揭示自然最普遍现象的理论体系称之为科学，确实是很可笑的。
我们之所以认为东方有科学体系，就是因为它站在气一元论假设之上构建了一个能够解释自然界一切的理论体系，这个理论的核心就是气理学说，即认为万物归一气，万物同一理，这个理就是物质系统产生、发展、壮大、衰退、灭亡的原理。它不是具体的东西，而是一种必然性关系的揭示，理解了它，就可以一通百通，进而理解万物的存在。
西方科学认识万物的方法论就是还原分析，而东方科学的方法论则是取象类比，即根据万物在运动原理上的统一性，通过系统间的类比来认识万物。有了这个方法论，我们就可以从宏观系统来认识微观系统，从可观察的系统现象来认识不可观察的系统现象，从而对自然的本质有一个更深刻的理解。
看看东西方科学的区别就知道了，西方科学迷信精密仪器，不承认观察不到的物质存在，结果造成了科学只是对表象规律的总结，而对本质几乎一无所知。而东方科学很早就认识到精密仪器的局限性，因为物质是彻底统一的，组成精密仪器的物质和所有被观测的物质本质上是一样的，用它只能观测由统一物质组织起来并出现个性的东西，而对共性的统一物质的混沌状态是永远不可观察的。也正是如此，虽然我们观察不到微观世界的物质运动，但中国的先人们仍然能够通过系统间的类比来认识它。如中医就建立在人与自然关系以及整体与局部关系的认识之上，而西医却基于观察不到就不存在的理由否定了这些关系，才造成了中西医之间的矛盾。
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