智障者被接收到学校后，把他们培养成什么样的人，是一个值得关注的问题。塞甘对此进行过深入的思考，并有着鲜明的主张。他认为对智障儿童的教育应以训练他们未来自立和对社会负责为最高目标。与此相应，智障学校的学生必须学会独立生活，具有一定的责任感。塞甘提出，应该让智障儿童学会既能处理自己的事务，也能参加力所能及的工作，并最终成为自食其力的人。当然，他认为，只有在学生能够自理之后，才能鼓励他们自立，让他们参加一些力所能及的工作。
在塞甘看来，智障学校应以让智障儿童学会自理、自立为出发点，教会学生基本的生活自理能力，为他们回归社会做好准备。具体课程应以身体机能训练、音乐教育、语言教育为主。另外，塞甘还提出应将地理、计算等课程引入智障儿童的教学。他认为，尽管智障儿童学习计算相当困难旭只要教师有耐心，引导学生反复训练，学生掌握简单的计算仍然是可能的。事实上，塞甘的学生经过训练后，有的不仅学会了加减法，还学会了乘除法。
如何对智障者进行训练和教育，塞甘的方法与伊塔德的做法一脉相传，并在其基础上有所发展。塞甘早期的工作建立在五种感觉都随触觉变化的观念基础上。塞甘相信，如果通过特殊的感觉运动练习的教学，智障儿童就可以学习。他的方法由一系列相互联系的步骤组成：训练肌肉系统；训练神经系统；训练感觉器官；获得整体观念；发展抽象思维能力；获得深刻理解力；进行道德及社会认知的练习。塞甘对智障儿童的训练主要包括：①运动觉及各种感觉的训练，包括肌肉系统的训练、触觉训练、听觉训练等。②智力恢复训练，包括说话训练、写字训练、阅读训练及学科基础知识训练等。③道德和社会化训练。
塞甘在对智障儿童进行教育的过程中，始终强调要将心理、教育、医学与哲学等理论兼收并蓄。他不厌其烦地指出：“要将智障孩子带人美好的生活之中。，，①换言之，就是要让智障学生也能参与到家庭、游戏和学习中来，享受其中的乐趣和幸福。据此，他在教学中非常重视学生自理能力和日常生活技能的学习与提高，并在对智障儿童教学的实践中，探索出一套行之有效的教学方法。这些方法主要有以下几方面。
1．身体锻炼法
主要是指根据不同学生的身体健康和机能损失情况，设计出以其生理上的机能恢复为目的的训练。例如，按摩、擦桌子、捡石子、行走、唱歌、爬梯子、荡秋千等。在他看来，给学生布置这样的任务，既可以锻炼学生的身体，也可以防止智障儿童感到无聊，可谓一举两得。
2．音乐训练法
塞甘别具创意地运用与音乐相关的声音来训练学生的听觉。他曾经提出下列理由来说明音乐在智障教学中的功能：第一，音乐会让智障儿童快乐，而不会对其有伤害。第二，在辛苦的活动后，音乐为孩子们提供休息的机会。第三，音乐可以让不愿活动的孩子开始动起来。第四，音乐可让神经器官保持警醒，反应迅速，有效地支持思考的运用。第五，音乐可将智障儿童的忿怒、厌倦、忧郁等情绪转化为温和的感觉。第六，音乐是极佳的精神安定剂。在塞甘音乐教育理论的指导下，当时的一些学校成立了由弱智学生组成的乐队，并能进行演出。
3．语言强化法
塞甘认为，对智障儿童来讲，说话是最难教的，但说话又非常重要。基于此，他在教学中鼓励孩子在从事每一种活动时都要尽量发出声音。即便是在写字训练时，他强调也要运用说话的技能。当孩子写字时，他要求孩子将那个字的发音说出来。这种与正常儿童写字训练大相径庭的教学方法，体现出塞甘致力于提高智障儿童言语能力的良苦用心。在对学生进行语言训练时，塞甘通常遵循循序渐进的原则。具体做法是：先指导学生进行发音练习，训练时教师用手将弱智儿童遵循的口型予以固定，然后教师教学生发单音节的音，最后才教学生说词语、句子。
4．教具辅助法
在对智障儿童的教学中，塞甘还设计了各种不同的教具，有区别地训练缺陷儿童。例如，利用纽扣让儿童系扣子，利用鞋带让儿童系鞋带，利用刺激感官的工具给儿童做玩具，让他们从玩耍中学习经验，等等。
塞甘曾把他的这套复杂的、系统的训练方法进行总结，并将之命名为生理学方法( physiological method)。塞甘在发展他的方法时，经常从教育、哲学和医学角度出发，欣然地改编其内容和技术，使其得到进一步完善，并考虑应用在正常儿童身上。若联想到他早期的医学训练及在巴士底和萨尔贝特耶的经历，塞甘关于生理学方法的持久努力就可以理解了。
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