基因武器，也称遗传工程武器或DNA武器。它运用先进的基因重组技术，用类似工程设计的办法，按人们的需要通过基因重组，重新制造新的或经过基因改造的细菌和病毒。
未来可能出现的基因武器主要有两大类型：
新型的微生物战剂
这一大类型是专门破坏人体免疫系统的微生物战剂。它主要是通过在一些致病细菌或病毒中导入能对抗普通疫苗或药物的基因，或者在一些本来不致病的微生物体内“插入”致病基因，来培养出新的抗药性很强的病菌或致病微生物。
随着基因组学的进展，肺结核、麻风病、霍乱等病菌的完整基因序列已经发表，鼠疫杆菌等的基因组测序工作也将完成，这些天然的细菌和病毒都可能通过基因重组而被改造成易存储、便携、毒性更大的生物武器。例如，炭疽热可以用青霉素的衍生物来治疗，但是，如果在炭疽杆菌中引入一种内酰胺酶基因，就可以使抗生素失效。这种操作对一些较好的生物实验室来说，不过是小事一桩。除此之外，对细菌稍加改造，提高其毒性，或者使其不容易被检测出来等，都是完全可以做到的。如1994年，斯坦梅尔曾在《自然》杂志发表论文，披露利用这种技术，培育出了一种新型大肠杆菌，这种大肠杆菌对抗生素的耐药性是普通大肠杆菌的3.2万倍。论文发表后不久，美国微生物学会就去信表示出对这种技术可能被滥用的担心，并要求毁掉培育出的新型大肠杆菌。斯坦梅尔照办了。
潜在的生物武器设计者还可能看中其它一些技术，包括基因治疗技术。在基因治疗中，要将特定基因导入人体内，需要经过处理的病毒作为载体。研究人员指出，这种载体同样可能用来携带有害的基因。
人种基因密码武器
这一大类型是专门根据特定人种生化特征上的差异，或称人的基因密码，来设计一种只对特定遗传特征的人们产生致病作用的致病菌，以达到有选择地杀死敌方有生力量的目的，这种基因武器又称人种密码武器。因为每类人种都有自己特定的基因密码，一旦不同种群的DNA被排列出来，就可以生产出针对不同种群的人种密码武器，造成敌方人种灭绝。从而克服普通生物武器在杀伤区域上无法控制的缺点。
根据基因武器的特殊性能，可以预计，一旦基因武器运用于战争，将使未来战争发生巨大变化。基因武器是现代生物技术制造出的新型生物武器，它与常规武器相比有以下几个特点：
（1）成本低，杀伤能力强，持续时间长。
基因武器对人员的杀伤阈值是分子水平，无论是对机体的哪个部位，或者通过机体哪个途径，只要能在机体内“插入”基因武器，哪怕是“插入基因武器的一个分子”，也同样能够起到杀伤作用。有人估算，用5000万美元建造一个基因武器库，其杀伤效能远远超过50亿美元建造的核武器库。据称，某国曾利用细胞中的脱氧核糖核酸的生物催化作用，把一种病毒的DNA分离出来，再与另一种病毒的DNA相结合，拼接成一种剧毒的“热毒素”基因毒剂，用其万分之一毫克就能毒死100只猫；倘用其20克，就足以使全球55亿人死于一旦。
（2）传送与扩散方法简单，施放手段多样。
只要将病毒放在一只普通的密码箱中，就可轻易通过海关检查；只要将基因细菌或病毒喷洒在空气中或者倒入饮用水里，就可让成千上万的人毙命。还可以用人工、飞机、火箭、气球、水面舰艇、水下潜艇以及火炮等把基因战剂施放到目标区。当成千上万的人被病毒杀伤时，人们还蒙在鼓里，以为是流行病在作怪。而且，查清病毒来源与属性需要时间。
（3）不易被发现，难治难防。
因为经过改造的病毒和病菌基因，只有制造者才知道它的遗传“密码”，其他人很难破译和控制。同时，基因武器的杀伤过程是在秘密之中进行的，人们一般不能提前发现和采取有效的防护措施。一旦感受到伤害，为时已晚，在此之前早已遭到基因病毒的侵袭，很难治疗。这是基因武器与其他生物武器、化学武器的主要区别。
（4）攻击敌方时，可以保存基础设施和武器装备不受损坏。
基因武器只大规模杀伤有生力量而不破坏非生命物质。
（5）基因武器具有强大的威慑作用。
能给对方造成极大的心理压力，使对方士气大落，惊慌失措，草木皆兵。
基因武器一旦出现，其战略威力将比核武器还要大，因为拥有这种武器的人不必顾虑对自己及对地球整体环境的破坏。基因武器的使用者再也不必兴师动众，而只需在战前将基因病菌投入他国地域，或利用飞机、导弹等将带有致病基因的微生物投入他国地域，让病毒自然扩散、繁殖，就会使敌方人畜在短时间内患一种无法治疗的疾病，从而丧失战斗力。此外，基因武器可根据需要任意重组基因，可在一些生物中插入损伤人类智力的基因。当某一特定族群的人沾染上这种带有损伤智力基因的病菌时，就会丧失正常智力。种族基因武器甚至还可以无声无息地消灭某些民族，例如降低其出生率或提高其婴儿夭折率，或是压制这个群体内的某种抗体，提高他们接触病菌的机会。尤其值得关注的是，基因武器杀人于无形，人们一般不能提前发现和采取有效的防护措施，一受害的族群发现遭毒手时，往往为时已晚，可能已濒临灭绝边缘。在战术上，基因武器不易被发现，将使对方防不胜防。
为了保护全人类的最大利益，维护和促进世界和平与发展，有效防范基因武器的潜在威胁，1972年联合国就通过了“禁止试制、生产及销毁细菌（生物）和毒剂武器公约”，1975年联合国再次通过了“禁止使用生物化学武器”的决议，但少数国家发展生物武器的步伐却一天也没有停止过。俄罗斯情报人员认为，世界上约有10至15个国家已经制定或正在制定基因与生物战计划。英国生物学家断言，基因武器的问世不会晚于2010年。基因武器一旦问世，人类将面临难以避免的灾难。
